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TECNOLOGIAS DE SECUENCIACION MASIVA DE GENOMAS - Coggle Diagram
TECNOLOGIAS DE SECUENCIACION MASIVA DE GENOMAS
SEGUNDA GENERACION
Ilumina
ABI-SOLID
454 Pyrosequencing
IonTorrent
GENOMA
GEN
Producción de una proteína específica
Las unidades básicas de la herencia;
Segmento dentro de la muy larga cadena de ADN
Numero de genes de organismos
Drosophila
13,000
C. elegans
20, 000
Arabidopsis
27, 600
S. Cerevisiae
5,400
H. sapiens
25, 000
Totalidad de la informacion genètica que esta codificada en el ADN o ARN en el caso de los virus
HISTORIA
1987
.
Secuenciador automático AB370. 96 bases a la vez, 500 K bases al día, 600 Pb longitud
2003
Publicación del genoma humano. 10 años para secuenciar y 3 años para el análisis.
2007
NGS, Segunda generación. Una sola corrida genera 1 GB de datos
2011
NGS, tercera generación. Una corrida genera 1 TB de datos. 1000x más eficiente
Actualidad
Hoy es posible secuenciar más de 5 genomas humanos en una sola corrida
1977
Frederick Saenger. Nucleótidos terminadores de cadena. 1 secuencia a la vez
PRIMERA GENRACION
Ventajas
Alta calidad de las secuencias en fragmentos largos de hasta 900pb
Útil para secuencias individuales de fragmentos de DNA de plásmidos de bacterias o amplificado por PCR
Limitaciones
Su elevado costo por base lo hace ineficiente para proyectos a gran escala
Tiempo largo
TERCERA GENERACION
PacBio
Oxford nanopore technologies
