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TRASPOSIZIONE GENICA, MECCANISMO DI RETROTRASCRIZIONE - Coggle Diagram
TRASPOSIZIONE GENICA
MECCANSIMO EUCARIOTICO
TIPO 1 (RETROTRASPOSONI)
SINE (SHORT INTERSPERCED NUCLEAR ELEMENT)
CIRCA 100-300 Bp
CONTENGONO SOLO ELEMENTI TRASPONIBILI, NECESSITANO DELLE ORFPs
LINE (LONG INTERPERSED NUCLEAR ELEMENT)
CIRCA 6Kb E SONO AUTONOMI (CODIFICANO PER LE PROTEINE DI RETROTRASPOSIZIONE NECESSARIE)
ORF1 -> CODIFICANO PER LE ORF1P
LEGANO L'RNA FORMANDO IL COMPLESSO RIBONUCLEOPROTEICO
LO STABILIZZA E TRASPORTA VERSO A REGIONE ACCETTRICE
ORF2 -> CODIFICANO PER ORF2P
ENDONUCLEASI E RETROTRASCRITTASI
APRE IL DNA OSPITE, STAMPA IL cDNA E LO INTEGRA
NON LTR
MECCANISMO DI RETROTRASPOSIZIONE
ORF1P -> COMPLESSO RIBONUCLEOPROTEICO
TAGLIA REGIONI AT RICH, SI FORMA IL SITO DI INSERIMENTO DI RNA
L'RNA VIENE SINTETIZZATO E TRAMITE LA RETROTRASCRITTASI ORF2 VIENE UTILIZZATO COME STAMPO PER LA SINTESI DI cDNA (DNA COMPLEMENTARE)
COPIA E INCOLLA
LTR
IDENTIFICATI DA LUNGHE SEQUENZE TERMINALI RIPETUTE (CIRCA 5KBP)
TIPO 2
TAGLIA E INCOLLA
1️⃣ RICONOSCIMENTO → LA TRASPOSASI RICONOSCE LE SEQUENZE TERMINALI INVERTITE (IR) DEL TRASPOSONE.
2️⃣ TAGLIO → LA TRASPOSASI TAGLIA IL DNA RIMUOVENDO IL TRASPOSONE DALLA POSIZIONE ORIGINALE.
3️⃣ PREPARAZIONE SITO BERSAGLIO → LA TRASPOSASI CREA UN TAGLIO A FORCELLA NEL NUOVO SITO.
4️⃣ INSERIMENTO → IL TRASPOSONE SI INSERISCE NEL NUOVO SITO DEL DNA.
5️⃣ RIPARAZIONE → ENZIMI CELLULARI RIEMPIONO GLI SPAZI LASCIATI NEL DNA.
6️⃣ STABILIZZAZIONE → LA LIGASI SIGILLA IL DNA E FISSA IL TRASPOSONE NELLA NUOVA POSIZIONE.
MECCANISMO PROCARIOTICO
TIPO I
UN GENE FA DA TRASPOSONE
1 PORZIONE IS
2 SEQUENZE PER L'ATTACCO DELL'ENZIMA
TIPO II (COMPOSITI)
OLTRE A CONTENERE I GENI PER LA TRASPOSIZIONE CONTENGONO GENI ACCESSORI
2 PORZIONI DA TRASFERINE, CONTENENTI SOLITAMENTE GENI DI RESISTENZA
4 PORZIONI IS
2 PER GENE
2 REGIONI D'ATTACCO
TRASFERIMENTO O REPLICAZIONE DI REGIONI DI DNA DA ZONE DONATRICI A ZONE ACCETTRICI
FONDAMENTALE PER I PROCESSI EVOLUTIVI
LA REGIONE TRASFERITA E' DETTA TRASPOSONE
I TRASPOSONI SONO RICONOSCIUTI DA SPECIFICI ENZIMI (TRASPOSASI) IN BASE ALLE SEQUENZE DA CUI SONO INDIVIDUATI
DUE DOMINI
RICONOSCIMENTO
RICONOSCE E LEGA LE IR (SEQUENZE INVERTITE E RIPETUTE)
CATALITICO (TAGLIO)
TRIADI CATALITICHE Asp-Asp-Asp O Asp-Asp-Glu
IL TAGLIO E' ASIMMETRICO (SI FORMANO CODE 3' E 5')
VIENE INSERITO IL TRASPOSONE ALL'INTERNO DEL TAGLIO
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I RETROTRASPOSONI VENGONO TRASFERITI INVECE DALLA RETROTRASPOSASI
CONTENUTO ALL'INTERNO DI DUE SEQUENZE RIPETUTE E INVERTITE, CON REGIONI DI LEGAME PER LA TRASPOSASI
TRE TIPI
CONSERVATIVI
VENGONO ESCISSI E REINTEGRATI IN REGIONI DIFFERENTI
REPLICATIVI
VENGONO UTILIZZATI I TRASPOSONI COME STAMPI PER REPLICARLI E INSERIRLI IN ALTRE REGIONI
RETROTRASPOSONI
PASSANO PER INTERMEDI A RNA CHE VENGONO RETROTRASCRITTI (cDNA) E INSERITI IN ALTRE REGIONI
MECCANISMO DI RETROTRASCRIZIONE
L'RNA STAMPO HA DELLE CARATTERISTICHE PECULIARI
GLI ESTREMI SONO SEQUENZE RIPETUTE INVERTITE
ALL'INTERNO DI UNA REGIONE CODIFICANTE E' PRESENTE LA REGIONE PBS (PRIMER BINDING SITE)
UTILIZZATA PER CODIFICARE E LEGARE UN tRNA CHE FA DA PRIMER PER LA RETROTRASCRITTASI
LA REGIONE PBS E' VICINA A UNO DEI DUE ESTREMI
A PARTIRE DAL tRNA PARTE LA SINTESI DI cDNA
VIENE SINTETIZZATA LA PORZIONE INVERITA RIPETUTA
SALTO SULL'ALTRA PORZIONE IN MODO DA SINTETIZZARE TUTTO IL cDNA
DAL cDNA SI STAMPA IL COMPLEMENTARE CHE VIENE INSERITO NEL LOCUS DESIDERATO