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REPLICAZIONE DEL DNA - Coggle Diagram
REPLICAZIONE DEL DNA
3 IPOTESI
CONSERVATIVA
ESPERIMENTO DI MESELSON STAHL
SI E' FATTA CRSCERE UNA COLTURA DI E. COLI IN TERRENO DI N15, POI SPOSTATA IN N14
CON L'AUMENTARE DEI CICLI REPLICATIVI DIMINUIVA SEMPRE PIU' IL DNA PESANTE (DIMEZZANDOSI DI VOLTA IN VOLTA)
GEN 1) 2 DNA MEDI (1PESANTE E 1LEGGERO)
GEN 2) 2 DNA MEDI E 2 DNA LEGGERI
SEMICONSERVATIVA
VERA
DISPERSIVA
A OPERA DI DNA POLIMERASI
CHE USA
NUCLEOTIDI TRIFOSTATO (DA AGGIUNGERE)
SINGLE STRAND DNA (ssDNA), STAMPO
PRIMER, RNA DI INNESCO
AGISCE PER SELEZIONE CINETICA
QUANDO LE BASI NON SONO CORRETTAMENTE APPAIATE (MISMATCH) LA SINTESI RALLENTA DI MOLTO
PROOFREADING
ESEGUITO DA UN DOMINIO ESONUCLEASICO 3' 5'
RIMUOVE I NUCLEOTIDI IN DIREZIONE 3' 5' FINO A RAGGIUNGERE QUELLO ERRATO, LO RIMUOVE. POI LA SINTESI RIPRENDE
A SEGUITO DI MISMATCH SI HA UNA PESSIMA INTERAZIONE PALMO-NUCLEOTIDE CHE DISTACCA LA POLIMERASI DAL FILAMENTO. A SEGUITO DI CIO' SI INNESCA LA CORREZIONE
TRAMITE UN RIGONFIAMENTO NEL SITO ATTIVO IMPEDISCE AI RIBONUCLEOTIDI DI ACCEDERVI (INGOMBRO DI -OH 3')
STRUTTURA ORGANIZZATA IN 3 DOMINI
PALMO: BETA FOGLIETTO CONTENENTE IL SITO ATTIVO PRINCIPALE
UTILIZZA IONI Zn++ E Mg++ PER NEUTRALIZZARE LA CARICA DEI FOSFATI
SI OCCUPA DEL PROOFREADING
GRAZIE ALLE INTERAZIONI H COL SOLCO MINORE DELL'ELICA CHE STA SINTETIZZANDO. SE LE INTERAZIONI SONO SCARSE (SINTOMO DI MISMATCH) LA VELOCITA' DIMINUISCE
DITA: AVVICINANO IL NTP AL PALMO, STABILIZZANDOLO CON Mg++ E Zn++
PRESENTANO ANCHE Lys E Arg (STABILIZZAZIONE CARICA) E Tyr PER GARANTIRE LA COPLANARITA' DURANTE L'APPAIAMENTO
UNA VOLTA CHE IL LEGAME E' FORMATO SI CHIUDONO PER AVVICINARE ZINCO E MAGNESIO
POLLICE: INTERAGISCE COL DNA IN SINTESI E LO STABILIZZA PER TENERE TUTTO IN POSIZIONE OTTIMALE PER L'ATTACCO
DATO CHE IL DNA PRESENTA DUE FILAMENTI
FORCA DI REPLICAZIONE
FILAMENTO LEADING (SINTETIZZATO 5' 3')
UN SOLO PRIMER, SINTESI DIRETTA
FILAMENTO LAGGING (SINTETIZZATO 3' 5')
PRIMER MULTIPLI INTERVALLATI
FRAMMENTI DI OKAZAKI
PRCOARIOTI 1000bp
EUCARIOTI 200bp
ELICASI
PROTEINE ESAMERICHE AD ANELLO, CIRCONDANO IL DNA E LO DIVIDONO ROMPENDO I LEGAMI H (USANO ATP)
ssBP (SINGLE STRAND DNA BINDING PROTEIN) O RPA (REPLICATION PROTEIN A)
PROTEINE BASICHE A SFERA, SI LEGANO AL FOSFATO ISOLANDO I DUE FILAMENTI
TOPOISOMERASI
LAVORA IN TANDEM CON ELICASI
RIMUOVE AVVOLGIMENTI E SUPERAVVOLGIMENTI CHE SI CREEREBBERO APRENDO I FILAMENTI (COSTRIZIONE GEOMETRICA)
RNA PRIMASI
RNA POLIMERASI CHE SINTETIZZA IL PRIMER (INNESCO)
POST SINTESI
DNA pol 1 (PROCARIOTI)
RIMUOVE I PRIMER E SOSTITUISCE
RNAasi H RIMUOVE I PRIMER, LA POLIMERASI SOSTITUISCE (EUCARIOTI)
LIGASI
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