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ACIDI NUCLEICI - Coggle Diagram
ACIDI NUCLEICI
DNA
DOPPIA CATENA DI NUCLEOTIDI
BASE AZOTATA
PURINE
ADENINA GUANINA
MANIFESTANTI EQUILIBRIO TAUTOMERICO
PIRIMIDINE
CITOSINA TIMINA
I DOPPI LEGAMI CONIUGATI CONFERISCONO PROPRIETA' OTTICHE (ASSORBANZA)
DESOSSIRIBOSIO
GRUPPO FOSFATO (FOSFODIESTERE)
ORIENTATA 5' 3' E 3' 5'
ORGANIZZAZIONE DEL DNA: CROMATINA
DNA AVVOLTO SULLE PROTEINE (1,65 GIRI)
ISTONI
PROTEINE BASICHE (CARICHE POS) RICCHE DI Arg E Lys
DOMINIO DETTO HISTON FOLD
3 ALPHA ELICHE UNITE DA ANSE
CODA ISTONICA N TERMINALE
SEDE DELLE MODIFICHE ATTE AD ADDENSARE LA CROMATINA
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5 TIPI
H1
STRUTTURE SUPERIORI (PIU' ORDINATE)
H2A E H2B
COPPIA DI DIMERI
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H3 E H4
TETRAMERO
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NUCLEOSOMA: LIVELLO DI ORGANIZZAZIONE
UNITI TRA LORO DA PORZIONI DI DNA INTRONICO (DNA LINKER) -> "FILO DI PERLE"
H1 PUO' AVVICINARE I NUCLEOSOMI ORGANIZZANDOLI MAGGIORMENTE
FIBRA A 30nm
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SECONDO MOTIVI ISTONICI ESAGONALI CON IL NUCLEOSOMA ALL'ESTERNO
EUCROMATINA
PIU' TIPICA (90% DEL TEMPO), PIU' RILASSATA
ETEROCROMATINA
MENO APERTA, SI ORGANIZZA COME CROMOSOMA IN FASI REPLICATIVE
CROMOSOMA
GRADO DI MASSIMA COMPATTAZIONE DEL DNA
DOPPIA ELICA DESTRORSA
SOLCO MAGGIORE
CHE INTERAGISCE CON I DOMINI PROTEICI
SOLCO MINORE
CONFORMAZIONE A, B, Z
A: SCHIACCIATA, B: TRADIZIONALE, Z: SINISTRORSA
REGOLE DI CHARGRAFF
1) COMPOSIZIONE IN BASI VARIA TRA UNA SPECIE E L'ALTRA
2) LE MOLECOLE DI DNA NEI TESSUTI DISTINTI NON VARIANO PER COMPOSIZIONE
LA COMPOSIZIONE DEL DNA NON VARIA CON ETA' E NUTRIZIONE
LA SOMMA DELLE PURINE E' PRESSOCHE' UGUALE ALLA SOMMA DELLE PIRIMIDINE
TOPOLOGIA
LINKING NUMBER (L)
L = nT + nW
TWIST = AVVOLGIMENTO TRA I SINGOLI FILAMENTI
WHRITE = AVVOLGIMENTI TRA I DOPPI FILAMENTI
E' SEMPRE COSTANTE IN UN DNA STATICO
VIENE MODIFICATO DALLE TOPOISOMERASI
TOPO I
AGISCE SUI TWIST
NON CONSUMA ATP (SFRUTTA L'ENERGIA POTENZIALE DOVUTA ALLA GEOMETRIA TORSIONATA DEL DNA)
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TOPO II
AGISCE SUI WHRITE
CONSUMA ATP
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CI SONO INIBITORI DI ENTRAMBI CHE AGISCONO PRIMA O DOPO IL TAGLIO
POSSONO PORTARE A NICK O FORMAZIONE DI PROTEINE TRONCHE (SOLITAMENTE CITOTOSSICHE E/O INSOLUBILI)
RNA
SINGOLA CATENA DI RIBONUCLEOTIDI (RIBOSIO COME ZUCCHERO, URACILE INVECE CHE TIMINA)
PUO' ASSUMERE CONFORMAZIONI (STR. TERZ.) PARTICOLARI E ACQUISIRE PRORPIETA' CATALITICHE
PSEUDONODO: DOPPIO NODO FACILMENTE CONOSCIBILE DALLE PROTEINE
A MINORE: DOPPIA ELICA DI RNA CHE INTERAGISCE CON RESIDUI DI ALANINA
TETRA ANSA: STELO DI G-C CHE TERMINA CON UNA ANSA DI URACILE
CERNIERA LAMPO DI RIBOSI: ELICA CON BASI ALL'ESTERNO E RIBOSIO INTERNO (LEGAMI H INTRACATENA)
L'OH IN POSIZIONE 2' (ASSENTE IN DEO.RIB.) PUO' EFFETTUARE ATTACCHI NUCLEOFILI AI FOSFATI
CODICE GENETICO
3 CARATTERISTICHE
DEGENERATO
NON AMBIGUO
RIDONDANTE