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Communautés - Coggle Diagram
Communautés
Métacommunautés
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Les Indices de similarité/dissimilarité doivent respectésdeux critères :
1) La mesure doit être indépendante de la taille de l’échantillon et du nombre d’espèce présente dans la communauté
2) Relation linéaire = La mesure doit augmenter de manière fluide et cohérente d’un minimum fixé à un maximum fixé lorsque deux échantillons de communauté deviennent de plus en plus similaires. (II. Jolliffe, I. T., et Cadima, J. (2016)
Les coefficients de similarité binaire sont utilisés lorsque seules les données de présence/absence sont disponibles pour l'espèce dans une communauté
Indice de Rekonen/Le pourcentage de similarité = Mesure où les abondances des espèces dans chaque échantillon sont converties en pourcentages.,
Mesure sensible aux changements additifs, ce qui signifie que l'ajout ou la suppression d'espèces dans un échantillon affectera la similarité. Mais la mesure est aussi insensible aux différences proportionnelles d'abondance entre les échantillons, elle n'accorde pas d'importance à la taille des communautés
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Jaccard = de nos jour, utilisé comme coefficient de dissimilarité
Équation # 1
Analyses de cluster = méthodes permettant de réaliser une classification d'une série d'échantillons selon le coefficient de similarité/dissimilarité entre les différentes communautées (IV. Rohlf, F. J. (1982)
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Divisive ou agglomérative = division de l'ensemble des échantillons en classes en commençant par les échantillons individuels.
Monothétique ou polythétique = distinction de deux groupes frères par un attribut comme la présence d'une espèce
Données qualitatives ou quantitatives = utilisation de données quantitatives pour éviter de peser autant les espèces rares que les espèces communes.
Regroupement à liaison unique ("Single Link Clustering") = anaylse statstiques basé sur le regroupement de communautés où les communautés comportant les la plus proche n'appartenant pas encore au même cluster.de la similarité1dissimilarité entre deux communautés et on les classes
Exemple de regroupement a liasion unique présente dans le document word : tableau #1 + tableau #2 + Figure #1
Sorensen = accorde plus d’importance aux espèces communes donc le coefficient est plus sensibles aux similarités
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Les coefficients quantitatifs vont nécessiter la mesure de l'abondance relative pour chaque espèce en plus de l'absence et la présence des espèces dans les différentes communautés
L'abondance relative permet de déterminer l'importance de l'espèce dans la communauté
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La corrélation entre la diversité et la productivité selon deux échelles, Locale vs Régionale (Royle, N. J. (2013).
À l'échelle régionale, la diversité augmente linéairement avec la productivité (figrue #5)
À l'échelle locale, la diversité culmine à une productivité intermédiaire = forme parabolique (figure #4)
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