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LEZIONE 2: TOPOLOGIA DEL DNA - Coggle Diagram
LEZIONE 2: TOPOLOGIA DEL DNA
LA TOPOLOGIA È LO STUDIO DELLA CONFORMAZIONE SPAZIALE, INTERNA ED ESTERNA DEL DNA.
UN ESEMPIO SONO I SUPERAVVOLGIMENTI, CHE SI DIFFERENZIANO DAI NORMALI AVVOLGIMENTI PER UN'ULTERIORE SOVRAPPOSIZIONE DEI FILAMENTI DI DNA
LINKING NUMBER
L = A (AVVOLGIMENTI) + Sa (SUPERAVVOLGIMENTI)
RIMANE COSTANTE UN UNA CATENA A DOPPIO FILAMENTO DELLA STESSA LUNGHEZZA.
NEL CASO DI UN SUPERAVVOLGIMENTO DESTRORSO, IN CUI UNA CATENA A DOPPIO FILAMENTO SI INTRECCIA CON ANDAMENTO DESTRORSO, POSSIAMO SCRIVERE N = 1 (+1)
PER SUPERAVVOLGIMENTI SINISTRORSI SI SCRIVE N = 1 (-1)
VALE LO STESSO PER IL NUMERO DI AVVOLGIMENTI
T (TWIST)
W (WHRITE)
NUMERO DI VOLTE CHE UNA DOPPIA ELICA INCROCIA L'ALTRA
NUMERO DI VOLTE CHE UN FILAMENTO INCONTRA L'ALTRO
RUOLO DELLE TOPOISOMERASI
LE TOPOISOMERASI SONO ENZIMI CAPACI DI MODULARE LA TOPOLOGIA DELLA MACROMOLECOLA, NE ESISTONO DI DUE TIPI E I MECCANISMI DI AZIONE SONO SEPARATI E DISTINTI
TOPOISOMERASI 1 (AGISCE SENZA CONSUMO DI ATP, AUMENTA IL LINKING NUMBER DI 1, AGISCE SU UN SOLO FILAMENTO)
1 STEP, IL FILAMENTO SINGOLO VIENE TAGLIATO DAL SUPERAVVOLGIMENTO
STEP 2, IL FILAMENTO VIENE FATTO RUORARE LIBERAMENTE ATTORNO AL FILAMENTO INTERNO AD ESSO APPAIATO
STEP 3, (RIFORMAZIONE DEL FILAMENTO DI DNA)
TOPOISOMERASI 2 (CONSUMA ATP, AUMENTA IL LINKING NUMBER DI 2, AGISCE SU DUE FILAMENTI)
APRE PRIMA UN FILAMENTO, POI L'ALTRO, GARANTENDO COSI' IL PASSAGGIO DI UN'ALTRA PORZIONE DELLA DOPPIA ELICA.
QUESTI ENZIMI, LAVORANO MODIFICANDO LA PROPRIA CONFORMAZIONE (CONSUMANO ATP SFRUTTANDO IL CAMBIO CONFORMAZIONALE DELLA MODIFICA POST FOSFORILAZIONE)
TALE ENZIMA VIENE DETTO A DOPPIO CANCELLO
COME VIENE INIBITA?
L'INIBITORE LEGA IL SITO ATTIVO INGOMBRANDOLO, IMPENDENDO DUNQUE LA POSSIBILITA' DEL DNA DI LEGARSI, IMPOSSIBILITANDO L'AZIONE DEL PRIMO TAGLIO.
L'ATTIVITA' DELLA TOPOISOMERASI PUO' ESSERE INIBITA ANCHE DOPO IL PRIMO TAGLIO, PERMETTENDO LA TRADUZIONE DI UNA CERTA QUANTITA' DI PROTEINE, CHE POSSONO RIVELARSI TOSSICHE
GLI INIBITORI SI CLASSIFICANO IN BASE ALLA TOPOISOMERASI SU CUI ESPLICANO LE LORO PROPRIETA'. SONO UTILIZZATI COME ANTIPROLIFERANTI NELLE TERAPIE ONCOLOGICHE