El Consejo Interterritorial del Sistema Nacional de Salud está compuesto por el Ministro de Sanidad y Consumo, quien lo preside, y los Consejeros de Sanidad de las comunidades autónomas. La vicepresidencia de este órgano será uno de los Consejeros competentes en materia de sanidad de las comunidades autónomas, elegido por los Consejeros que lo integran. Cuenta con una Secretaría permanente, cuyo titular es propuesto por el Ministro de sanidad y consumo, y ratificado por el mismo, asistiendo a las sesiones con voz, pero sin voto. Según los temas a tratar, pueden incorporarse otros representantes de la Administración General del Estado o de las comunidades autónomas.