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sempre proteine biochimca - Coggle Diagram

- - - - Si distinguono fondamentalmente tre tipi di strutture secondarie:
      - α-elica
      - β-foglietto
      - Turn (ripiegamenti) e loop (anse)
- - - - Ogni giro dell'elica corrisponde a 3,6 aa residui amminoacidici e a 5,4 Å (0,54 nm), ogni aa occupa 0,15 nm.
      - In ogni giro si formano legami ad idrogeno tra l'H dell'azoto amminico e l' O del carbonile del 3° aa successivo.
      - Tutti i gruppi R degli aa sono proiettati verso l'esterno e verso l' estremità N-terminale dell’elica. In questo modo si evitano interferenze steriche con la catena polipeptidica principale e tra le catene laterali stesse.
    - - Gli amminoacidi privi di carica (come l'alanina) formano spontaneamente alfa eliche.
      - Gli aa con R costituito da un gruppo carico (come nella lisina -NH3+) non formano alfa eliche a causa della repulsione tra le cariche delle catene R.
      - Gli aa con catene ingombranti (come quella dell'isoleucina) impediscono la formazione di alfa eliche se si ripetono a distanza ravvicinata in una stessa catena polipeptidica, a causa della collisione tra le catene R e i carboni alfa.
      - La prolina interrompe l'alfa elica in quanto possiede un anello rigido che destabilizza la struttura e non possiede l'atomo di H sull'azoto necessario alla formazione del legame ad idrogeno con l'O del gruppo C=O
    - - L'α-elica si può formare sia con D-aa che con L-aa ma non D-aa e L-aa insieme.
      - L' α-elica che si forma dagli L-aa può essere destrorsa o sinistrorsa; quella destrorsa è più stabile.
      - Le α-eliche di tipo sinistrorso sono molto rare.
      - Una caratteristica delle α- eliche è che mostrano un potere destrorotatorio maggiore a quello che ci si aspetterebbe valutando la somma dei poteri rotatori degli aa che la compongono.
      - Le catene polipeptidiche avvolte casualmente mostrano un potere rotatorio che è la somma del potere rotatorio dei singoli amminoacidi.
        
        Quando le proteine vengono denaturate mostrano un potere levogiro maggiore di quello della struttura nativa