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RNA splicing - Coggle Diagram
RNA splicing
alternative splicing
一個基因有2種以上剪接方式,
造成RNA序列不同, 蛋白質不同
只有U5蛋白相同
minor = AT-AC splicesome
轉錄後修飾 ,選擇性剪接
retain
alternative(與時間有關)
extend
skipped
normal
activator& repressor(調控蛋白)調節
sliencer & enhancer(核酸序列)
hnRNP辨識
RS domain增加splicesome親和力
移除intron 組合exon
5端&3端 splice site
branch site : A
branch point A -OH攻擊5端 splice site
5端-2端 joint
5 splice site的3端-OH攻擊
3 splice site 的5端
形成intron lariat + exon
splicesome : snRNP + 沒有和RNA接在一起的protein
snRNA + protein = snRNP核糖核蛋白
辨識5端splicing site (U1 ,U6)
& branch site (U2)
branchpoint (A) binding protein
U1 ,U6不同時期辨識同一位置
結合 (U6, U2)
催化 BBP(branchpoint binding protein)+U2輔助因子
snRNA (U1, U2, U4, U5, U6)
U3不參與mRNA splicing
self splicing 不須外力蛋白,自身splicing
(原始)
group I 沒有branch A
G 帶3端OH攻擊
尾端變G ,不形成環
group II 同mRMNA splicing
單股intron 自身形成2級結構 摺疊
domain 特定結構 具酵素活性
splicing催化 釋放intron
RNA editing
轉錄後修改RNA序列
去胺基 C變U, A變I
guide RNA(gRNA) 插入或刪除U
5端anchor目標結合位
editing region
3端 poly U
trans splicing : 不同股的RNA組合
cis splicing : 2個exon在同一條RNA上
沒有U1蛋白