analisi di linkage, basata sullo studio di caratteri polimorfici, ci permette di capire qual è il pezzo di genoma che è responsabile della malattia, seguendo la segnalazione dei caratteri polimorfici. Più i loci sono vicini più è difficile che avvenga il crossing over, geni linked sono localizzati sullo stesso cromosoma, la frequenza di ricombinazione è misurata in centiMorgan, vi è un calcolo statistico, calcola la frequenza di ricombinazione se siano vicini o lontani i soci, si fa infine un calcolo statistico che restituisce il LOD score, se >= di 3 allora sarà significativo, invece sarà escluso se <= di 0, il calcolo necessita di un numero sufficiente di famiglie (numero di meiosi informative alto)