Gram positivas: Responden al pigmento y aparecerán al microscopio en color morado, poseen una gruesa capa de peptidoglicano (mureína), lo cual les confiere gran resistencia pero las hace retener mucho mejor el tinte.
Gram negativas: Resisten la tinción y lo harán de color rojo o rosado, poseen una doble membrana de lípidos en su envoltura, por lo que requieren de una capa de peptidoglicano mucho más delgada y, por ende, no se tiñen de la misma manera.