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REGOLAZIONE GENICA - Coggle Diagram

- - - - attivatori
        
        dopo che si lega favorisce il legame tra l'RNA polimerasi e il promotore => lettura del filamento
      - repressori
        
        dopo che si lega funge da ostacolo fisico che impedisce alla RNA polimerasi di potersi legare al promotore o di poter proseguire nella lettura del filamento
      - i fattori di regolazione hanno 2 regioni, i domini
        
        uno serve al fattore di regolazione per legarsi al DNA
        
        e uno dove si lega la molecola effettrice (piccole molecole che a volte controllano i fattori di regolazione)
        
        il repressore è legato vicino al promotore e svolge il suo lavoro => si lega una molecola effettrice =>il repressore cambia forma => si stacca => RNA procede con la trascrizione
        
        molecola effettrice che attiva un repressore: corepressore
        
        molecola effettrice che disattiva il repressore: induttore
        
        nella trascrizione l'informazione di un gene viene trascritta in una molecola di RNA messaggero
        
        per risparmiare energia a volte i geni strutturali che codificano per polipeptidi con funzione correlata vengono trascritti in una sola molecola di RNA messaggero
        
        delimitata da 2 seguenze
        
        sequenza leader (5')
        
        sequenza trailer (3')
        
        non codificanti
        
        al suo interno abbiamo 3 sequenze, disposte l'una dopo l'altra, delimitate da un codone di arresto e di inizio (a volte tra un codone di inizio e uno di fine ci sono 10 nucleotidi)
        
        2° sintetizza per il polipeptide 2
        
        3° sintetizza per il polipeptide 3
        
        1° sintetizza per il polipeptide 1
        
        codificanti
  - - - operatore
        
        sequenza regolatrice dove si andranno a legare i fattori di regolazione
      - geni strutturali
        
        codificano per le proteine
        
        se sono più di 1 le proteine avranno funzione correlata
      - promotore
        
        sito di inizio della trascrizione
    - - codificano per i fattori di regolazione
      - non fanno parte dell'operone => sono sparsi nel cromosoma
    - - operone lac codifica gli enzimi che digeriscono il lattosio
        
        operoni la cui espressione dipende da un repressore controllato da molecole effettrici
        
        lattosio
        
        no
        
        la cellula, per non sprecare energia, non si procura gli enzimi che lo utilizzano
        
        il repressore si lega all'operatore => RNA polimerasi non può trascrivere il gene => i geni che codificano per gli enzimi per il metabolismo del lattosio non vengono espressi
        
        si
        
        la cellula è interessata a esprimere quei geni utilizzati per il metabolismo del lattosio
        
        allolattosio, molecola effettrice (primo composto che si forma nel metabolismo del lattosio), si lega al repressore facendolo staccare => RNA polimerasi trascrive il gene => vengono sintetizzati gli enzimi per il metabolismo del lattosio
    - - operone trp
        
        triptofano (amminoacido)
        
        si
        
        alla cellula non interessa sintetizzarne altro perchè già a disposizione
        
        il triptofano agisce da molecola effettrice legandosi al repressore, fungendo da compressore => permette al repressore di legarsi all'operatore => RNA polimerasi non può trascrivere il gene
        
        no
        
        cellula esprime i geni per la sintesi di esso
        
        RNA polimerasi si attacca al promotore e procede con la trascrizione perchè il repressore è inattivo
      - la cui trascrizione può essere annullata in certi momenti
- - - - insieme di proteine espresse dalla cellula, cambia a seconda del tipo di cellula e di quali geni essa esprime
  - - - eucromatina
        
        condensata durante divisione cellulare, decondensata durante interfase
        
        geni possono essere espressi
      - eterocromatina
        
        sempre condensata
        
        geneticamente inattiva
        
        costitutiva presente in tutte le cellule nella stessa posizione in una coppia di cromosomi omologhi
        
        centromero
        
        regione dei cromosomi omologhi che non porta geni che devono essere espressi perchè l'unica funzione è permettere ai cromosomi di legarsi al fuso mitotico nella divisione cellulare
        
        corpi di barr
        
        nella coppia di cromosomi sessuali femminili (2 X), per evitare di avere un numero di proteine doppie un cromosoma x viene compattato per non essere espresso => corpo di barr
        
        facoltativa varia di condensazione nei diversi tipi cellulari o stadi di sviluppo
    - - metilazione
        
        rilassata => condensata
        
        aggiunta agli istoni di gruppi metilici => istoni caricati più positivamente
        
        DNA carica negativa nel complesso per via del gruppo fosfato => maggiore affinità tra istoni e DNA => si avvicinano
      - acetilazione
        
        condensata => rilassata
        
        aggiunta agli istoni di gruppi acetili (aggiunti da polienzimi = pistone acetiltransferasi) => istoni più carichi negativamente
        
        DNA carica negativa => minore affinità => si allontanano
  - - - sito di inizio della trascrizione
        
        dove la RNA polimerasi inizia a sintetizzare l'RNA messaggero
      - sito degli elementi regolatori
        
        enhancer attivano espressione gene
        
        specifici per ogni tipo di cellula
        
        silencer silenziano espressione gene
      - TATA box
        
        sito di riconoscimento per RNA polimerasi
        
        promotore basale
    - - formazione complesso di pre-inizio
        
        l'attivatore (fattore da cui dipende l'inizio del processo) si lega sull'enancer
        
        TFIID si lega al TATA box => richiama tutti gli alti fattori per formare il complesso di pre-inizio