Primária: Anormalidade Genética ou Anormalidade Anatômica, Disgenesia gonadal, incluindo Síndrome de Turner, Agenesia Mülleriana (ausência de vagina, as vezes ausência de útero, Atraso Fisiológico da Puberdade (atraso constitucional da puberdade, doença sistêmica crônica, doença aguda), SOP, Deficiência isolada do Hormônio liberador de Gonadotropina, septo vaginal, perda de peso ou anorexia nervosa, hipopituitarismo.