Aproximadamente 30 organizaciones e instituciones que trabajan en la innovación y desarrollo productivo fueron invitadas a la reunión, éstas se encargaron de elegir mediante votación a las instituciones que conformarían la primera directiva del CDI, que quedó a la cabeza del Centro de Investigación Agrícola Tropical (CIAT), dependiente de la gobernación cruceña, quedando además dentro de la directiva la Universidad Autónoma Gabriel René Moreno, el INIAF, la Asociación Nacional de Productores de Oleaginosas y Trigo, y CIPCA Santa Cruz, entre otras.