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Modulo 2 - Coggle Diagram

- - - - selezione a favore di un allele completamente nuovo
      - 1 variante, 1 gene
    - - 1 gene + varianti
    - - più varianti + geni
- - - - modello semplice
      - modello di mutazione reversibile
- - - - incroci casuali
        
        popolazioni infinite
        
        mutazioni trascurabili
        
        migrazioni trascurabili
        
        mortalità e fertilità indipendenti dal genotipo
- - - - non radicato || radicato (radice=antenato comune)
      - inclusione outgroup || midpoint rooting
    - - tipo di dato, basati su:
        
        le distanze
        
        i caratteri
      - tipo di algoritmo, metodi di:
        
        clustering
        
        searching
      - UPGMA
        
        basato sulle distanze che usa algoritmo di clustering
        
        albero ultrametrico
        
        distanza taxa-radice sempre uguale >> tasso di evoluzione costante
      - Neighbor-Joining
        
        basato sulle distanze che usa algoritmo di clustering
        
        principio di minimum evolution >> minor somma della lunghezza dei rami
        
        no tasso di evoluzione costante
      - Massima parsimonia
        
        basato sui caratteri che usa algoritmo di searching
        
        principio della parsimonia >> minor numero di cambiamenti evolutivi
- - - - progressiva omogeneizzazione
    - - metepopolazione
        
        pop uguali
        
        tasso m di scambio
        
        migrazione bidimensionale
        
        no struttura geografica
    - - distanza geografica
    - - le pop sono simili a quelle più vicine >> gradiente