Fue tercer jefe del Batallón Concepción Nº 27 durante las batallas de San Juan y Miraflores (enero de 1881) durante la Campaña de Lima. Herido, se retiró al valle del Mantaro, a su hogar, con el propósito de recuperarse. Peñaloza E. 1882, se encontraba en Huamancaca Chico, allí tenia su casa-hacienda.
Las fuerzas chilenas llegaron a la casa de los Peñaloza Arauco, en señal de venganza fueron quemados vivos Teodoro Peñaloza, su madre Andrea Arauco y una criada.