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El reloj molecular moderno - Coggle Diagram
El reloj molecular moderno
Descubrimiento del reloj
El descubrimiento de que una proteína dada tiene una tasa
característica de evolución
Motoo Kimura y Tomoko
La mayoría de los cambios de aminoácidos en una proteína son neutrales
Las mutaciones ventajosas son raras
La tasa a largo plazo de evolución molecular neutral en especies es la misma que la tasa de mutación neutral en individuos
Dickerson
Comparó las estructuras proteicas de las
histonas, el citocromo c, las hemoglobinas y los fibrinopéptidos
Cuanto mayor era la proporción de sitios neutros más rápida es la tasa de evolución molecular
Teoría neutralista
Las variaciones ni útiles ni perjudiciales no se verían afectadas por la selección natural, y quedar como un elemento fluctuante, como tal vez vemos en ciertas especies polimórficas, o finalmente quedar fijo
Un reloj descuidado
"La tasa de evolución
molecular debería ser constante"
Teoría neutral
Descuido de la tasa de tic tac
Cambios en la t asa de mutación
Errores en la estimación de fechas moleculares
Desigualdad de la tasa
de sustitución en un linaje (efectos residuales)
variación en la tasa de sustitución entre linajes (efectos de linaje)
Una tasa de ticks variable
El reloj molecular es probabilístico, no determinista
Distribución de intervalos entre eventos desustitución ('ticks'), comúnmente descrita por una DISTRIBUCIÓN DE POISSON
Las secuencias para las que muchos sitios pueden cambiar y mantener la estructura tridimensional tenderán a tener secuencias vecinas que también tienen muchos sitios variables
Los vecinos tenderán a tener tasas similares de
evolución molecular
La fuerza de selección puede cambiar
Produciendo ráfagas de sustituciones
Puede cambiar el coeficiente de selección de un gen completo
Pseudogenes tienen una tasa rápida de evolución molecular permiten la mayoría de los cambios en la secuencia.
Otra fuente de variabilidad proviene del efecto del tamaño
de la población
Las fluctuaciones de la población
podrían contribuir al descuido del reloj molecular
Las poblaciones pequeñas se ven más gravemente afectadas
Fijación de alelos casi neutros de efecto selectivo pequeño sea
mayor en poblaciones pequeñas
Tasas diferentes para grupos diferentes
Puede variar
A través de cambios en la tasa de mutación
El tamaño de la población
Los coeficientes selectivos
Historia de vida de una especie
La tasa de mutación varía claramente entre taxones
Parte de esta variación se debe a diferencias en el equipo
de reparación
Las mutaciones surgen
Por errores durante la replicación del ADN
Daños que no se reparan
La eficiencia de reparación del ADN varía incluso entre
especies con genomas similares.
La tasa de mutación se ve afectada por las propiedades bioquímicas de las enzimas de replicación y
reparación
Que tan confiable es el reloj molecular
Permite una percepción de los procesos
bioquímicos, selectivos y poblacionales
Proporciona una herramienta notable
para investigar la historia evolutiva
Tasa de evolución
molecular es relativamente constante
Esta escala de tiempo molecular puede proporcionar información sobre la historia de todos los organismos a partir de los cuales podemos obtener secuencias genéticas
Los relojes pueden alcanzar todas las escalas de tiempo de la evolución
Casos controvertidos deberían de ser una advertencia al interpretar las fechas moleculares.
La teoría de la evolución molecular
La naturaleza descuidada de la tasa de sustitución da resultado una gran variación en torno a la cantidad de diferencia
genética esperada para un período de tiempo determinado
La teoría casi neutral predice
que la tasa de evolución molecular está influenciada por la tasa de mutación, el tamaño de la población y las proporciones
relativas de sitios con diferentes coeficientes selectivos
Estimación de fechas cuando las tasas varían
Buscar genes que tengan una tasa uniforme en todos los taxones bajo consideración de una prueba de reloj
Carecen de potencia para secuencias
más cortas
Reconocer el grado de variación de la tasa en los datos y utilizar esta
información para poner límites a las posibles fechas de divergencia