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TGF-β, 核糖体合成和EMT的关系, 可变剪接机制验证, BUD31 in SOC, 胰岛素激活PI3K, + - Coggle Diagram
TGF-β
Smad非依赖途径
激活mTORC2
驱动EMT
核糖体
激活
Smad依赖途径
核糖体合成和EMT的关系
核糖体参与EMT进程的机制探讨
激活沉默的rDNA操纵子
Snail1及相关核糖体生成组件调节rRNA生成
mTORC2和EMT的关系相关
验证EMT的进程和rRNA的关系
体外验证
rRNA生成和细胞停止增殖是EMT过程的一个重要标志
NMuMG细胞系
MCF7细胞系
PY2T细胞系
rRNA生成和EMT是否并行
体内验证
rRNA生成和细胞停止增殖是EMT过程的一个重要标志
鸡胚胎
鼠胚胎
验证EMT进程和核糖体生成的关系
体外验证
核糖体生成组件表达上升是EMT的标志
核糖体生物发生也发生在细胞周期停滞期间
核糖体生成是EMT进程的必要条件
CX5641干扰
体内验证
小鼠神经嵴群细胞
核糖体生成和实体瘤的关系
核糖体生成的时间和部位特点
核糖体在肿瘤侵袭转移中的作用
可变剪接机制验证
RNAseq数据的组学分析与验证生物学功能和通路
根据组学分析参考基因发挥的表型功能作用
BUD31发挥可变剪接的机制验证
发挥直接剪接作用的鉴定
RNA位点基序位点鉴定（Clip-seq）
RNA-pull down 反向沉淀/EMSA
RIP正向沉淀
和核斑点的共定位
和其他剪接因子蛋白的互作
下游分子鉴定
筛选方式
取交集
RNA-seq
clip-seq
验证方法
定量RT-PCR验证产生的转录本相对表达量比值
发生剪接改变的转录本功能验证
rescue(体内/体外)
体内
体外
半定量RT-PCR验证可变剪接具体模式
相关蛋白表达量表达改变验证
BUD31 in SOC
BUD31在卵巢癌中的筛选鉴定
预后
自己的临床样本数据
公共数据库
体外增殖功能初筛
表达量
（公共）蛋白数据库
(公共)RNA数据库
治疗
ASO设计与鉴定
功能作用
体外鉴定
体内鉴定
质控
调控剪接模式
时间依赖
浓度依赖
调控蛋白表达
胰岛素激活PI3K
直接结合
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