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Expresión de genes, Referencias: JoVE. (2022). Chapter 10:Gene Expression…

- - - - Los genes de mantenimiento se expresan en menor cantidad de manera continua pero requieren niveles altos de transcripción
  - - - de igual manera los 3 tipos de ARN polimerasa se unen a diferentes reguladores transcripcionales
  - - - es mas común y ayuda a la caja TATA para mejorar la unión de los TF
    - - Se encuentra bajo al sitio de inicio de la transcripción y se encuentra generalmente en promotores que no tienen caja TATA. Por lo general funciona junto con el DPE para la regulación de la transcripción
- - - - Células hepáticas producen la enzima Alcohol deshidrogenasa (descompone alchoholes tóxicos en acetaldehidos que puede luego ser metabolizado en H2O y dióxido de carbono)
      - Las neuronas producen Neurexinas, proteinas que permiten que se pase información de una neurona a otra
  - - - Cuando los niveles de glucosa disminuyen el páncreas secreta glucagón lo cual genera que el hígado produzca fosfoenolpiruvato carboxinasa, proteína necesaria para la producción de glucosa
- - - - Heterodímero
        
        formado por diferentes tipos de monómeros
      - Homodímero
        
        formado por los mismos tipos de monómeros
- - - - Se une aun promotor lo cual a su vez genera la unión de la ARN polimerasa y da inicio a la transcripción
    - - Actúa con un operador, la unión de estos dos genera la que la ARN polimerasa no se una al promotor y no se da la transcripción
        
        Un operador es una secuencia de ADN ubicada cerca del promotor
- - - - Luego el ARNm debe asociarse con proteínas de unión al ARN para formar un complejo conocido como una RIBONUCLEOPARTÍCULA
        
        Luego la RIBONUCLEOPARTÍCUA se mueve al citoplasma y el control transcripcional se puede dividir en dos
        
        Regulación específica
        
        La inhibición de la traducción está controlada por la interacción con elementos de transacción (ej: proteínas y ciertos tipos de ARN)
        
        Regulación general
        
        Las diversas proteínas en implicadas en la traducción son activadas o inhibidas lo cual afecta las transcripciones
- - - - esta regulación es necesaria en la reprogramación in vitro de células diferenciadas
        
        La expresión de TF Oct-4, Sax-2, Klf-4 y c-Myc en células sómaticas desencadenan la conversión a células madres
        
        La ausencia de los primeros 3 no permite la conversión, y en ausencia de c-Myc su eficencia baja
  - - - Regulan los gene como la diferenciación celular
      - Su funcionamiento dependen de la coordinación con otros factores de transcripción
- - - - coactivadores
        
        Un ejemplo es la acetiltransferasa
        
        transfieren un grupo acetilo a la histona, lo que provoca el aflojamiento del ADN y promueve la transcripción.
      - corepresores
        
        Un ejemplo es la desacetilasa
        
        eliminan los grupos acetilo provocando un empaquetamiento apretado del ADN alrededor de las histonas, evitando la transcripción.
- - - - Dominio unión ADN
        
        contienen patrones característicos, incluidos motivos comunes como las estructuras hélice-giro-hélice, dedo de zinc y cremallera de leucina.
      - Dominio activador
        
        recluta coactivadores que promueven la transcripción a través de varios mecanismos
        
        Un ejemplo es la modificación de histonas,dando un mayor acceso de la maquinaria transcripcional al ADN.
- - - - Usa varios mecanismos para evitar la transcripción
        
        Se une a la secuencia cis impidiendo la unión de un activador
        
        se une a un sitio cercano al sitio de unión del activador y su dominio represor interactúa con el activador evitando la unión
        
        Se une a los sitios de unión de factores de transcripción generales y bloquea el ensamblaje de la maquinaria transcripcional.
        
        Utilizan su dominio represor para reclutar corepresores que suelen tener actividades enzimáticas que pueden inhibir la transcripción.
- - - - Luego los TF se introducen en el núcleo celular por medio de vectores virales y se incorporan al genoma
- - - - MyoD: participa en la diferenciación muscular, induce la producción del Factor 2, necesario para el gen que transcribe desarrollo y reparación muscular
      - Oct4 y Sox 2 trabajan juntas para regular la expresión del TF Zfp206, necesario para la diferenciación celular
      - PPAR-gama y C/EBP-alfa: activan el desarollo de adipocitos
- - - - Adición de grupos metilo o acetilo a las histonas, provocando que la cromatina se pliegue más o se desenrolle facilitando la transcripción
    - - Micro ARN y pequeños ARN de interferencia
        
        Alteran la estructura de la cromatina
      - ARN mensajero
        
        puede ser metilado, alterando la traducción genética
    - - Se añaden metilo a bases específicas, alterando la habilidad proteínas reguladoras para unirse al ADN, impidiendo la transcripción
- - - - Ej: el alelo del padre puede tener una metilación que influya positivamente en la transcripción, mientras que la madre no tenga esa metilación y afecte negativamente la expresión del gen