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VIRUS - Coggle Diagram

- - - - Clearance più lenta: 2 anni
      - Prevalenza: 70-75% 20 anni, poi calo
      - Screening per il carcinoma del collo dell'utero
      - 300.000 in Europa: più soggette a cancro anale
    - - Clearance più veloce: 5,9 mesi
      - Prevalenza: 50-60% costante
      - Non ci sono programmi di screening: diagnosi stadio avanzato
      - 315.000 in Europa: più soggetti a tumori testa-collo e verruche genitali; importante il cancro al pene
  - - - Malattia rara, 1° anno (materno-fetale durante passaggio con contatto lesioni HPV associate benigne): proliferazioni benigne a livello delle corde vocali -> alterazione voce, abbassamento tono, afonia, difficoltà respiratoria --> rimozione chirurgica; anticorpi monoclonali
  - - - Cute: palmo, pianta, periungheale
      - Mucosa: ano-genitale, orale, alte vie respiratorie -> giunzione squamo-colonnare con metaplasia (cervice, ano-retto, rino-oro)
    - - 2) PERSISTENTE-LATENTE: DNA rimane plasmidico, non integrato alle cellule basali -> rischio di perdita E2 nell'integrazione -> proliferazione
      - 1) PRODUTTIVA: colpisce le cellule basali dell'epitelio pluristratificato squamoso e sfrutta fattori cellulari acquisiti durante il differenziamento (E1-E2 basali, E5-E6-E7 intermedi, E4-L1-L2 superficiali) -> le cellule superficiali presentano il virus completo
  - - - LR: late region (proteine strutturali)
        
        L2: centrale e meno esposta
        
        L1: forma i pentameri, usata per il vaccino
      - ER: early region (proteine funzionali precoci)
        
        E4: regola assemblaggio e rilascio virione
        
        Oncoproteine
        
        E6: ubiquitinazione-degradazione p53 -> uscita da G1
        
        E7: competitore di pRb, libera E2F -> ingresso fase S
        
        E5: 1)blocca pompa protoni per degradazione EGFR (lega vacuolarATPasi)-> maggior esposizione EGFR; 2) lega e blocca complesso EVER1/EVER2-ZnT1 -> aumenta Zn intracellulare -> aumenta replicazione virale (AP-1, E2)
        
        E1-E2: regolano replicazione ed espressione oncoproteine (E2 inibisce sintesi E6-E7)
      - URR/LCR: regione regolatoria (comprende ORI)
        
        modulata da fattori cellulari e virali
  - - - 2a: possibile carcinogeno
      - 2b: probabile carcinogeno
      - 1: carcinogeno -> alfa9 (HPV16) e alfa 7 (HPV18)
      - 3: non carcinogeno -> alfa 10 (HPV6, HPV11)
    - - Genere: PAPILLOMAVIRUS alfa (mucosali)- beta, gamma (cutanei)...
        
        Specie: alfa1, alfa2, alfa9...
        
        Cluster genotipico: HPV16, HPV18, HPV6...
  - - - mutazione di EVER1-2: aumento Zn intracellulare (cofattore fondamentale per ft come AP-1)
        
        carcinomi squamo-cellulari o lesioni benigne
  - - - 1) Cervice normale -> 2) Inizio rapporti sessuali e pubertà -> 3) Colonizzazione genitale da HPV
        
        10/20% lesioni pre-neoplastiche
        
        8/100.000 carcinoma
        
        80% asintomatiche
        
        +90% regressione e risoluzione in 2 anni spontaneamente
    - - Esame istologico (anatomia patologica): Neoplasie Intraepiteliali Cervicali -> morfologia alterata: citoplasma ridotto e nucleo allargato
        
        CIN2: 2/3
        
        CIN3: 3/3 (tumore in situ)
        
        CIN1: 1/3
      - Esame citologico (Pap-test): Lesioni Intraepiteliali Squamose
        
        LSIL: basso grado (CIN1)
        
        HSIL: alto grado (CIN2-3)
    - - Incidenza: 600000/anno
      - Mortalità: 348000/anno
      - Test molecolare per HPV16: 2,5% se citologia normale, 24% LSIL, 52,8%HSIL e 61% dei casi di carcinoma invasivi
      - su 100.000 donne: 70% sviluppa infezione virale, 400 HSIL e 8 carcinoma
    - - 3 grandi eventi
        
        Ruolo HPV nel carcinoma cervicale (1996): necessario ma non sufficiente
        
        Vaccini (2006): prevenzione primaria
        
        Pap-test: screening citologico -> 1941, calo del 50% dell'incidenza
      - PAP-TEST
        
        CIN2+ -> Sensibilità 60%- Specificità 80% (su 10.000 donne, 50 avranno CIN2/3 -> il test ne rivela circa 30!)
        
        Tampone cervicale e poi esame al microscopio
      - HPV-DNA test
        
        Alta sensibilità
        
        Rischio di sviluppare una lesione in futuro (ma molte si risolvono)
    - - Modelli
        
        1) Classico: Pap-test -> Colposcopia -> Biopsia mirata (bassa sensibilità)
        
        2) Nuovo: HPV-DNA test -> Pap-test -> Colposcopia -> Biopsia mirata
      - Donne 30-64
        
        HPV-DNA test HR
        
        POS: Pap-test
        
        POS: colposcopia
        
        NEG: HPV-DNA 1 anno
        
        POS: colposcopia
        
        NEG: HPV-DNA test 5 anni
        
        NEG: HPV-DNA 5 anni
      - Donne 25-29
        
        Pap test
        
        Anomalo
        
        ASCUS
        
        HPV-DNA test HR
        
        POS: colposcopia
        
        NEG: Pap/hpvdna dopo 3 anni
        
        =LSIL: Colposcopia
        
        NEG : HPV-DNA dopo 3 anni
  - - - HIV+: 30 volte
      - OMOSEX HIV+: 5 volte > omosex HIV-
  - - - GARDASIL (Tetravalente): HPV16-18 e HPV 6-11
      - CERVARIX (Bivalente): HPV16-18
      - 2015 in Europa Nonavalente: HPV 16-18-6-11-1-33-45-52-58
- - - - COMUNI: febbre (più nell'adulto che nel bambino), esantema, linfoadenopatia e congiuntivite
      - RARI: artrire autorisolvente, trombocitopenia, encefalite
      - 20-50% asintomatica
      - Incubazione 12-13gg
    - - 2° Trimestre: sintomi meno gravi progressivamente -> anemia emolitica, polmonite, meningoencefalite, epatosplenomegalia, ritardi mentali, autismo...
      - 3° Trimestre: nessun sintomo
      - 1° Trimestre (85%): microcefalia, sordità, cecità, cardiopatie
      - Prime settimane: aborto/morte endouterina
  - - - Genere: RUBIVIRUS
  - - - Via aerea
      - Contatto
    - - Viremia massima: rash cutaneo
      - Anche 7 gg prima (naso-faringe e sangue) e 7gg dopo
  - - - Positiva a IgM nel 1° trimestre: aborto terapeutico
      - Positiva a IgM dopo il 1° trimestre: ricerca RNA virale nel liquido amniotico o sangue fetale
    - - RNA nelle secrezioni naso-faringee o circolante
      - IgG e IgM (sono diagnostiche perché non passano la placenta)
- - - - Co-infezioni: aumenta epatite fulminante
      - Super-infezioni: peggioramento quadro clinico -> epatiti croniche attive e cirrosi
      - Colpisce solo HBsAg+
    - - Indiretta: test immunoenzimatici per IgM e IgG
      - Diretta: RNA nel sangue e HDVAg
    - - INFalfa -> a dosi massiccie può fare remissione, ma RNA rimane
      - Trapianto di fegato per casi estremi
      - Vaccino per HBV: protegge anche da HDV (non protegge il portatore di HBV da HDV
  - - - Germania e Francia: prevalenza elevata (20%) (sud Francia 86% sieropositivi -> circola più che nel resto della francia)
      - aumento di 10 volte in 10 anni -> è un'infezione in aumento per l'emigrazione
      - Principali colpiti: Maschi con + 50anni; effetti più gravi: donne in gravidanza
      - Occupazionale: macellai, cacciatori, agricoltori, veterinari...
      - Italia 2021: pochi casi nel centro-nord, 1 solo epatite fulminante -> uomo di 72 anni
    - - Zoonosi: circuito oro-fecale -> carne di suino (25%)-cinghiale (12%)cruda/poco cotta
      - Via verticale: madre-feto
    - - 2) Infezione silente/ epatite acuta
      - 3) Auto-risoluzione/epatite fulminante (trapianto di fegato)
      - 1) Incubazione: 2-6weeks (fino a 60 days)
    - - Famiglia: HEPEVIRIDAE
        
        Genere: HEPEVIRUS
    - - Epatite acuta: fatica, astenia, nausea, febbre, ittero
      - Risoluzione spontanea 1-5 weeks
      - Molti asintomatici
      - Mortalità: 20-25% donne in gravidanza (soprattutto genotipo 1 in Paesi in via di sviluppo acquisita nel 3° trimestre) -> recettori per il progesterone a livello placentare: recettore per virus -> infezione placentare -> forte risposta immunitaria con aborto ed epatite fulminante
  - - - Contatto con sangue infetto -> tossicodip, piercing, tatoo, sessuale, trasfusioni, dialisi renale, percutanea
      - Verticale (6%)
        
        viremia
        
        co-infezione con HIV (10% in più)
    - - ECDC (2019): 40.000 (6%acute, 22% croniche); uomo 2.1:1 donna; 25-34anni
      - Italia (2019): 21 casi (Lazio) (0,05/100.000)-> nosocomiale 45%; calo di piercieng, tatoo...; aumento sessuale
      - infezione
        
        acuta: droche endovena, omosex
        
        cronica: droghe endovena, nosocomiale
    - - Proteine
        
        3 Strutturali
        
        Core -> attiva ras, blocca p53 (ruolo oncogeno)
        
        E1-E2: spike -> E2 lega CD81; E2 ha un sito ipervariabile
        
        5 Non strutturali
        
        NS3: proteasi
        
        NS4: proteolitica
        
        NS2
        
        NS5A-B -> RNApolRNAdipendente
      - ssRNA+, 9600nt
      - Regioni più variabili: E1-E2; regioni più conservate: regolatrici della replicazione
    - - Infezione acuta 5%(5000) (epatite fulminante molto rara)
      - Infezione cronica 50-70% (50000-70000)
        
        Epatite cronica 30000-50000
        
        Cirrosi 12500-25000
        
        Epatocarcinoma 1250-2500 (1,25-2,5%)
      - Incubazione 2 mesi (50gg)
    - - RNA virale
      - Ig -> non neutralizzanti perché virus altamente variabile
    - - Famiglia: FLAVIRIDAE
        
        HEPACIVIRUS
    - - Simeprevir: inibitore NS3-4 vs genotipi 1-4
      - Daclatasvir: inibitore NS5A
      - SOFOSBUVIR
        
        Inibitore NS5B -> RNApolRNAdip
        
        Triplice terapia: insieme a PegIFN e RIBAVIRINA (inibitore indiretto)
    - - Acuta: HCV RNA e ALT nulle dopo 6 mesi
      - Cronica: HCVRNA persiste e picchi alternati di ALT dopo i 6 mesi
  - - - Europa 2016: incidenza 2.4/100.000 (varia: islanda 0; slovacchiia 25); m>=f; 5-14 e 0-4
      - 2017 picco: maschi (85%) sessualmente attivi (MSM 61%) di età mediana (34)
      - Seieva = Sistema Epidemiologico Integrato Epatite Virale Acuta
        
        ITALIA: incidenza <5, picco 2017, minimo 2020 (covid), 2021 126 casi (0,25/100.000) nord e vecchi
    - - Oro-fecale -> molluschi crudi/poco cotti 41%; frutti di bosco surgelati 23%
      - Contatto diretto (sessuale, percutanea) -> rischio aumentato tra MSM e viaggi in zone endemiche
    - - No sintomi/ dolori addominali e diarrea/ ittero franco (ittero+sub-ittero)
      - No cronicizzazione
      - Epatite fulminante: 0,5% (risposta immuno-mediata
    - - 2) Viremia: cala con anticorpi (6week)
      - 3) HAV feci: poco dopo l'inizio della viremia, continua anche dopo la comparsa delle ALT
      - 1) Incubazione: 25 giorni (2 settimane-45gg)
      - 4) Transaminasi: ALT-AST, danno epatico -> calano con anticorpi
      - 5) IgM (dopo 1 sett) e poi IgG (dopo 2-4 sett)-> IgG>IgM all'8 week; IgM: 3-6mesi; IgG: tutta la vita
      - Malattia: 2-8week
    - - EPAXAL: primo anno
      - HAVRIX: 5mesi-16anni o adulto
      - Immunità: 1 anno; 20 anni se booster a 6-12 mesi
      - Consigliato per chi va in zone endemiche
    - - Famiglia: PICORNAVIRIDAE
        
        Genere: HEPARNAVIRUS
    - - ssRNA+ 7470nt con VPg al 5' (per replicazione)
      - 4 proteine virali: VP 1-4
    - - dosaggio IgG importante per vedere chi si è immunizzato perché epatiti spesso asintomatiche
- - - - Mialgia epidemica/ Malattia di Bornholm (B): dolore muscolare scheletrico e cardiaco
      - Infezioni perinatali. neonato prematuro, sottopeso; rischio epatite-encefalite
      - Mano-piede-bocca (A16): malattia pediatrica con esantema (vescicole)
      - Miocardite infettiva: 1/3 acute causate da Cox
        
        resistenza se privi del recettore per Cox
      - Meningite asettica ( A e B) -> esantema ruboliforme in CoxA9
      - Danno diretto: scissura della distrofina -> necrosi e degenerazione tessuto
      - Faringite vescicolare/Herpangina (A): febbre, faringite con vescicole dolorose, vomito, dolori addominali
    - - Malattia minore (99%)
        
        2) Sintomi: assenti/comuni -> febbre, faringite, cefalea, nausea, vomito, diarrea
        
        3) Guarigione
        
        1) Incubazione: 17gg (5-40)
      - Malattia maggiore (1%)
        
        2) Forma leggera
        
        3) Guarigione apparente
        
        1) Incubazione 17gg
        
        4) Meningite asettica
        
        meningite lieve e rapida guarigione
        
        Poliomielite: degenerazione neuroni motori e paralisi flaccida
        
        Morte per arresto respiratorio
        
        Sindrome post-poliomielitica: astenia, dolori muscolari, atrofia muscolare
      - Patogenesi
        
        Replicazione orofaringe -> Canale digerente -> Intestino -> Placche di Peyer -> Linfonodi mesenterici -> I viremia --> possibile II viremia e infezione SNC
      - Diagnosi: isolamento virus/ PCR/ sierologica
      - Vaccino
        
        Vaccino di Salk (IVP)
        
        virus ucciso
        
        pro: no VAPP, sicuro ed efficace
        
        contro: no IgA mucosali (rischio diffusione); costoso; somministrazione intramuscolo
        
        Vaccino di Sabin (OVP)
        
        Contro: 2-4/1.000.000 VAPP (poliomielite paralitica associata al vaccino); neurovirulenza riaquisita in 12-18mesi
        
        Pro: non costoso, IgA mucosali, facile somministrazione, immunità passiva
        
        virus attenuato
      - Epidemiologia
        
        Corno d'Africa, Camerun e Siria: stop e ripartita
        
        India: netto miglioramento (vaccino)
        
        Af, Nigeria e Pakistan: mai fermata
- - - - Vettore: flebotomi
      - Epidemiologia
        
        Tutto il bacino del Mediterraneo: Francia, Spagna, portogallo, grecia,
        
        Toscana: prima identificiazione
        
        ER: diffuso
      - Genoma: ssRNA- segmentato (3)
      - Manifestazioni cliniche
        
        blanda sintomatologia
        
        severe: simili a WNV (meningoencefaliti)
        
        asintomatiche
      - Diagnosi
        
        differenziale (TOSCV-WNV)
        
        RNA (liquor e urine in fase acuta) e Ig (ELISA, IFA)
      - Caratteristiche: cavallo; sottodiagnosticata? emergente?
  - - - Vettore: zanzara AEDES
      - Epidemiologia
        
        Dopo il 2013: casi in America, USA e Europa
        
        2007 primo caso in Europa: Castiglione di Cervia- Castiglione di Ravenna da abitante originario del Kerala (India)
        
        Prima del 2013: endemica in Asia e America (fascia meridionale del mondo)
        
        Italia agosto-ottobre 2017: 2 focolai in Lazio e Calabria (ceppi circolanti in Pakistan e India)
      - Genoma: ssRNA+
      - Manifestazioni cliniche
        
        No asintomatici
        
        febbre alta, brividi, cefalea, nausea, vomito, mialgia, DOLORI ARTICOLARI INVALIDANTI
      - Caratteristiche: più diffuso del TOSCV
      - Diagnosi: molecolari e sierologica
  - - - Vettore: ZANZARA AEDES (Aegypti/albopictus)
      - Epidemiologia
        
        Europa: importazione e piccoli focolai (c'è il vettore)
        
        Incidenza in aumento: 30 volte maggiore negli ultimi 50 anni
        
        Endemica: Sud del mondo (Africa, Asia, America del Sud, Caraibi)
        
        Piano di sorveglianza Italia: DENV-ZIKV-CHIKV
      - Genoma: ssRNA+
      - Patogenesi
        
        Incubazione 3-14gg (3-7) -> infezione (di solito asintomatica/paucisintomatica) -> infezione 2 con sierotipo differente (forma severa): fegato, midollo osseo (piastrinopenia)
      - Caratteristiche: uomo serbatoio (non dead-end-host); importazione in Italia (non endemica); 4 sottotipi: DENV1-2-3-4 (bassa cross-protezione)
      - Manifestazioni cliniche
        
        Febbre Dengue: febbre, mal di testa, artralgie-mialgie, rash, dolore retro-orbitale
        
        Dengue severa: shock citochinico, sanguinamenti, compromissione multiorgano
        
        Asintomatica
      - Diagnosi
        
        NS1Ag: 1-10g dopo sintomi (proteina per la replicazione, altamente immunogena)
        
        IgM (5-7g) e IgG (8-10g)
        
        RNA: plasma (2-7gg dopo sintomi) e urine (più tempo)
      - Terapia
        
        Vaccino: DENGVAXIA -> complesso dei 4 sottotipi, usato in Sud America; rischio risposta iper-immune nei bambini
    - - Trasmissione
        
        Materno-fetale: replicazione nei trofoblasti; supera la barriera placentare
        
        Puntura di zanzara Aedes
        
        Sessuale: tropismo per testicoli -> sopravvive mesi nel testicolo, sperma e liquido vaginale di soggetti asintomatici
        
        Trasfusioni e trapianti
      - Manifestazioni cliniche
        
        Paucisintomatici: febbre, atralgia-mialgia, rash, congiuntivite, mal di testa
        
        Severe
        
        Adulto: Guillian-Barrè, meningo-encefaliti
        
        Neonato: microcefalia, calcificazioni cerebrali, ritardo psicomotorio...
        
        Asintomatici
        
        Testicolo: infetta spermatociti e cellule del Sertoli -> distruzione tubuli seminiferi -> calo ormoni sessuali, spermatozoi e fertilità
      - Epidemiologia
        
        2016: WHO allarme -> microcefalia e olimpiadi di Rio
        
        Piano di sorveglianza Italiano
        
        Endemica: Africa, Sud-Est Asiatico, Sud America
        
        1947 Uganda scimmie Rh- 1954 Nigeria
      - Diagnosi
        
        RT-PCR: RNA da sangue, urine, sperma, tampone vaginale
        
        Ig: ELISA,IFA, PRNT
        
        Difficile: possibili falsi positivi e cross-reattività; periodo viremico breve --> zika congiuntivite; dengue emorragia e schock; nei casi lievi sintomi uguali
      - Vettore: ZANZARE AEDES
      - Genoma: ssRNA+
      - Caratteristiche: alta omologia con Dengue (e WNV); serbatoio animale (scimmia Rh Uganda) e uomo
    - - Vettore: ZANZARA CULEX -> giugno-ottobre dal crepuscolo in poi
      - Epidemiologia
        
        Seconda metà 1900: primi casi di importazione in Europa
        
        Endemica: Europa, USA
        
        Uganda: primi casi (prima metà 1900)
        
        Italia: primo outbreak nei cavalli; 2008 primi casi (ER, Veneto)
      - Genoma
        
        Proteina strutturali: E (antirecettore, Ig neutralizzanti),M (pentrazione),C (capside)
        
        Proteine non strutturali: NS1 (immunogena, regola replicazione), NS5 (replicazione), NS3 (proteasi per virioni maturi), NS2A-B e NS4A-B (inibiscono INF...)
        
        ssRNA+
      - Patogenesi
        
        Incubazione 2-14gg -> infezione cheratinociti e CD nell'epidermide -> linfonodi -> circolo ematico -> supera BEE -> infezione SNC
        
        Neurotropismo: attraversa BEE grazie a -> infezione diretta dell'endotelio cerebrale, distruzione BEE per citochine, infetta monociti e li sfrutta, trasporto assonale retrogrado da neuroni periferici
      - Manifestazioni cliniche
        
        20% paucisintomatica -> WNF (west-nile fever): febbre, mal di testa, rash, atralgia-mialgia, astenia
        
        <1% WNND: meningo-encefaliti, paralisi, danni neurologici
        
        80% asintomatiche
        
        1/1000: encefalite letale
      - Diagnosi: test multipli (amplificazione PCR+ricerca Ig)
      - Caratteristiche: pericapside; uccelli selvatici->serbatoio; uomo e cavallo ->ospiti dead-end