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Filogenia Bacteriana mediante el Análisis del rRNA 16S, Técnicas, Estudios…

- - - - Uniformes en cuanto a sus propiedades
    - - máxima diversidad
  - - - Arbol Filogenético
        
        Relaciona todos los organismos
        
        Reconstruir historia de la vida
        
        Distancia evolutiva entre organismos
        
        Ej: origen de cloroplastos y mitocondrias es bacteriano
        
        Basado secuencias rRNA de las subunidades pequeñas del ribosoma (rRNA 16S)
        
        2.- Diferencias se valoran
        
        3.-toma como medida la distancia evolutiva entre otros organismos
        
        1.- Secuencias 16S de distintos organismos se comparan
        
        Basado en genes metabolicos ( árboles moleculares)
        
        Manipulación pequeñas moléculas
        
        Métodos taxonómicos basados en secuencias
        
        1 secuencia de genes
        
        Identifica organismo (tipo filogenético)
        
        Proporciona herramientas usadas para
        
        Identificar
        
        2 more items...
      - Brinda información
        
        Organiza distintos organismos
        
        Árbol de la Vida
    - - Dominio
        
        Eucarya
        
        más de 12 reinos
        
        Bacteria
        
        tantos mas reinos
        
        Diversidad en el planeta
        
        Archeae
  - - - Cultivo no cultivaba una buena parte de micoorganismos existentes.
      - estudios basados en morfología y fisiología.
      - uso de cultivos
  - - - Filogenia
    - - rRNA 18S
      - rRNA 16S
        
        Secuencias que se han mantenido uniformes a lo largo de la evolución
  - - - Mapa de la evolución
        
        Fuente principal de la vida
        
        Microbiana
        
        Organismos microbianos
        
        La procesos de la biosfera depende de sus actividades.
        
        Importantes en la subsistencia de la vida
        
        Descubrimiento reciente
        
        Siglo XIX
        
        1 more item...
        
        hace 300 años
        
        1 more item...
        
        Taxonomia según
        
        Propiedades metabólicas
        
        Gran cantidad de copias de rRNA en fase de crecimiento
        
        Vida inicial
        
        empezó nutrición inorgánica
        
        después
        
        fotosisntesis
        
        metabolismo energetico
        
        uso compuestos organicos
  - - - Con su metabolismo
        
        Marcadores quimiotaxonómicos
        
        Quimica
        
        Membrana
        
        Pared celular
        
        Composición transporte electrónico
    - - Cronómetro molecular
        
        proteína
        
        Contenido informativo codificado
        
        ácido nucleico
        
        Especial incidencia
        
        árbol evolutivo de las procariotas
        
        Cambios mutacionales quedan reflejados en la secuencia
        
        Número de cambios de las secuencias , equivale al tiempo transcurrido desde la divergencia de dos lineas evolutivas que comparte la molécula.
        
        No sujeto a transmision horizontal
        
        Longitud de la secuencia debe ser suficiente para que las semejanzas tengan validez
        
        Distribución universal
        
        Constancia funcional , que la presion selectiva que actua sobre la molecula sea minima
        
        Baja tasa de cambio de la molécula
        
        No sea excesivamente larga para aplicar tecnicas de secuenciación.
- - - - Homogeneados, microscopía de campo oscuro
    - - En las células, por microscopía electronica
    - - Sitio de sítesis de proteínas
    - - Dos subunidades
        
        Pequeña 30S
        
        molécula de RNA 16S y 21 proteínas
        
        Grande 50S
        
        rRNA 5S y rRNA 23S con 31 proteinas
    - - ARN transferencia
      - rRNA ribosomico
        
        conservado a traves de la evolución.
        
        Genes mejores conservados
        
        Excelente marcador molecular
      - ARN mensajero
  - - - Secuencias variables
        
        Información de bajo nivel filogenético
      - Secuencias preservadas
        
        Información de los eventos evolutivos mas tempranos.
- - - - Examinaron secuencia del rRNA 16S, de bacterias inusuales
      - rRNA 16S
        
        Escogió por universalidad y conservación en estructura y función
        
        Construcción de un árbol filogenetico
        
        la comparación de su secuencia
        
        facil identificacion de bacterias, microorganismos no cultivables
        
        Determina relaciones taxonomicas entre especies con poca relacion en su ADN
        
        Brindan el sitio de iniciación adecuado para le enlogacion de cebadores
        
        Adecuado en seres procariotas
        
        Util en los estudios taxonómicos
        
        Aplica en identificacion bacteriana
      - propuso
        
        Procariotes
        
        arqueobacterias
        
        eubacterias
  - - - de 118-120 pares de bases
  - - - usan dianas para oligonucleotidos
      - usada para establecer grupos y especies
      - Identificacion bacteriana
      - Hibridación
        
        Identificacion rápida de un gran numero de aislados
        
        Deteccion directa de microorganismos concretos en muestras
        
        Extracto de acidos nucleicos ( diana)
        
        clonar y detectar secuencias rRNA
        
        genes codifican las sondas