Em seu interior há uma solução aquosa de várias substâncias, como sais, carboidratos e proteínas. Os vacúolos são importantes nos fenômenos osmóticos e quando contêm pigmentos, como as antocianinas, são os principais responsáveis pela coloração azul, violeta, vermelha e púrpura de flores e folhas. Eles também atuam de modo semelhante aos lisossomos de células animais no processo de autofagia.