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Actividad telomerasa y mecanismos de reparación del DNA, Bibliografía,…

- - - - En la E.Coli estas dos proteínas se juntan para formar un complejo llamado primosoma en la cadena rezagada. Mientras la helicasa se mueve en la hebra de ADN la primasa se acopla y desacopla cada vez que se termine un fragmento de Okazaki y se necesita empezar uno nuevo
    - - Luego de el cebador del primosoma la polimerasa 3 continua con la replicación
        
        Este proceso se predice con el modelo del trombón
    - - Toposomerasa I: desenrolla una vuelta
      - Topoisomerasa II: desenrolla dos vueltas
    - - Presente en células germinales, fetales y algunas células madre.
    - - ADNpol δ y ε: responsables de la elongación.
      - ADNpol β: solo repara errores o daño.
      - ADNpol γ: participa en la replicación del ADN mitocondrial.
- - - - La polimerasa es capaz de escindir nucleótidos en dirección 5' a 3' y de 3' a 5' dando como resultado que la polimerasa son tres enzimas en un solo complejo, dos exonucleasas y la parte de la misma que es capaz de elongar el ADN
  - - - El genoma tiene una tasa de mutación de 1 en cada 100 ciclos parecido al la taza de la E.Coli
      - Los nucleótidos forman pares de bases entre A y T y C y G esta combinación genera una geometría similar entre las dos pero si se se juntan pares de bases incorrectas la geometría de el ADN se ve afectada y es fácilmente reconocida por los mecanismos de reparación de ADN
        
        La polimerasa tiene la capacidad de medir esta geometría y rechazar nucleótidos en el caso de no cumplir con la geometría correcta
      - Otra barrera de seguridad que existe para la alta fidelidad de la replicación del ADN es la actividad exonucleasa 5' a 3' esta entra en actividad cuando un par de bases mal pareado escapa de la selección por afinidad y geometría
        Como las bases mal pareadas generan una geometría que tiende a separar las hebras estas se mueven la acción exonucleasa 3' a 5' y eliminan la base incorrecta.
- - - - Una de las hebras originales queda en cada cadena hija. Fue confirmada por Meselson y Stahl en 1957.
    - - En eucariotas porque se sintetizan las cadenas en los dos sentidos, comenzando por las horquillas de replicación.
      - Además es multifocal, tienen muchos puntos de origen que son secuencias de Adeninas y Timinas, que ayudan a separar las hebras del replicón (unidad de ADN).
    - - En 1960 Reiji y Tsuneko Okazaki resolvieron como la cadena 5´-3´ se replicaba.
      - Hay dos hebras, la adelantada (se sintetiza en dirección de la orquilla) y la retrasada (en contra de la orquilla). La cadena retrasada se replica en fragmentos de Okazaki que varían entre 100 y 400 nucleótidos.
  - - - Comienza en las secuencias de replicación autónoma que están llenas de A y T con aproximadamente 300 bp, reconocidos por las proteínas de reconocimiento del sitio de origen.
      - Se forma la burbuja de replicación, por la separación de las cadenas con ayuda de las helicasas y estableciendo dos horquillas, de las cuales una se desplaza a la izquierda y la otra a la derecha.
      - Las proteínas estabilizadoras RPA se unen a las cadenas para estabilizarlas. El cebador es sintetizado por la primasas y las ADN polimerasas ya pueden empezar.
    - - Las ADN polimerasas añaden nucleótidos ayudadas por la PCNA, que mantiene a la polimerasa en contacto con el molde. Para evitar la tensión por el avance de la horquilla, la topoisomerasas I y II cortan y vuelven a unir pedazos.
      - En la hebra continua: se lo ejecutara en forma continua, con un solo cebador.
      - En la hebra retrasada: se necesita un cebador entre cada fragmento de Okazaki.
    - - la ADN Polimerasa δ llega al extremo del ADN, por lo que el mecanismo se separa.
      - En la hebra retrasada comienza la maduración: se debe eliminar los cebadores (por FEN1/RTH1 y RNasa H1), llenar su espacio (por ADNpol δ o ε) y unir todos los fragmentos (por ADN ligasa I).
    - - Tienen secuencias repetidas de 1 a 5 T y G. En la hebra retrasada no hay como poner un cebador más lejos del final de la cadena. Por lo que al quitarlos, hay una cadena más corta en las dos hijas. La telomerasa se unen y sintetizan los extremos de los cromosomas.
      - La telomerasa se une y sintetiza la cadena, las bases del ADN y ARN se emparejan, comenzando la primera elongación al añadir los nucleótidos (dNTPs). Se empieza a desplazar sobre el extremo elongado (translocación) y lo vuelve a elongar. Repite el proceso y la ADN polimerasa alfa rellena la hebra y la ligasa sella.
- - - - Plataforma de aterrizaje molecular,
      - Complejo de prerreplicación
- - - - Los primeros portadores de información genética eran probablemente moléculas de RNA que podían autorreplicarse.
        
        En 1953 Watson-Crick propuso que para la replicación de una molécula de doble hélice de DNA, la doble hélice se desenrolla, y cada una de las hebras parentales sirve como plantilla para la síntesis de una nueva hebra complementaria.
        
        En 1957 Mathew Meselson y Franklin Stahl usaron isótopos de nitrógeno pesados para distinguir entre hebras de DNA parentales y recién sintetizadas.
- - - - El origen de replicación en el cromosoma de la E. coli es una secuencia específica llamada oricC donde se unen varias proteínas para iniciar el proceso de replicación.
        
        El par de segmentos replicados se juntan y se unen al DNA no replicado se denominan horquillas de replicación.
        
        Cada horquilla de replicación corresponde a un sitio donde la doble hélice parental experimenta una separación de la hebra y se están incorporando nucleótidos en las hebras complementarias recién sintetizadas.
  - - - Es evidente que la separación de las hebras de una doble hélice es también un proceso de desenrollado.
        
        La separación de las dos hebras de una molécula de DNA circular es análoga a tener un extremo de una molécula lineal unida a una pared. la tensión que se desarrolla en la molécula no se puede aliviar mediante la rotación de la molécula completa.
  - - - El DNA recién sintetizado, marcado radiactivamente tenia la misma composición de bases que el DNA original no marcado, lo que sugiere en alto grado que las hebras de DNA habían servido como plantillas para la recolección de polimerización.
  - - - Ambas hebras recién sintetizadas se ensamblan en una dirección de 5'-3'.
        
        Las moléculas de polimerasa responsables de la construcción de las dos nuevas hebras de DNA se mueven en una dirección de 3'-5' a lo largo de la plantilla, y ambas construyen una hebra que crece mediante la adición de nucleótidos.
        
        La hebra que se sintetiza de forma continua se denomina hebra adelantada porque su síntesis continúa a medida que avanza a horquilla de replicación
        
        La hebra que se sintetiza de forma discontinua se denomina hebra retrasada porque la iniciación de cada fragmento debe esperar a que las hebras parentales se separen y expongan una planilla adicional.
        
        La enzima que une los fragmentos de Okazaki en una hebra continua de llama DNA ligasa.