Uno de los principales nudos de desigualdad se encuentra en la educación que atiende a la población indígena, El CONAFE brinda servicios educativos a poblaciones de mínimo 5 y máximo 29 estudiantes en edad escolar, que viven en zonas de alta pobreza, aislamiento y alto rezago social del país, por medio de intervenciones educativas que aseguren procesos de aprendizaje y enseñanza eficaces, así como mecanismos de formación docente y participación social eficientes, los servicios CONAFE se enfocan en la educación inicial de los niños de 0 a los 4 años, y en la educación comunitaria que es entre los 16 y 29 años