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PARCIAL 1 - Coggle Diagram
PARCIAL 1
ALINEAMIENTO DE SECUENCIAS
CONCEPTOS IMPORTANTES
LOCAL
programación dinámica
Algortimo de Smith-Waterman
objetivos
buscar dominios
buscar partes relevantes
unión a metal
región reguladora
regiones con alta identidad
GLOBAL
secuencias completas
maximizar coincidencias
programación dinámica
Algoritmo de Needleman-Wunsh
objetivos
secuencias homólogas
estudios evolutivos
BASES DE DATOS
NCBI
GENES
gene
PROTEÍNAS
protein
GENOMAS
genome
VARIANTES RELACIONADAS CON PATOLOGÍAS
dbSNP
EXTRAS
nucleotide - OBTENER SECUENCIAS GENÓMICAS
genome - ORGANIZACIÓN DE GENOMAS
"GENOME DATA VIEWER" - ver los cromosomas
"BROWSE BY ORGANISM" - información sobre porcentaje de secuencias completas, proteínas codificadas, etc
taxonomy - CLASIFICACIÓN DE ORGANISMOS
CONCEPTOS IMPORTANTES
Referencias RefSeq
TÍPICAS
NM_ - ARNm
NG_ - genes
NC_ - cromosomas
NP_ - proteínas
OTRAS
YP_ - proteínas que pasan de ADN a proteínas sin
pasar a ser ARN
NR_ - ARN no codificante (ARNt / ARNr)
WP_ - proteínas bacterianas