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OMICAS - Coggle Diagram
OMICAS
METABOLÓMICA
HUELLA METABÓLICA
medir efecto de toxinas o fármacos
BASES DE DATOS
REACTOME
KEGG
PROTEÓMICA
ESTRUCTURAL
rayos X o RMN
INTERACTÓMICA
interacción entre proteínas
TRANSCRIPTÓMICA
TÉCNICAS
MICROARRAYS (CHIPS)
hibridar muestras con sondas
marca: AFFYMETRIX
RNA-SEQ
similar al NGS
Ventaja: identificar variantes de splicing
registros: FASTAQ
BASES DE DATOS
GEODATASET
GEOPROFILE
RNA SE CONVIERTE A CDNA (transcriptas inversa)
ESTUDIOS
sanos vs enfermos
células madre vs diferenciadas
normal vs tratamiento
GENÓMICA
METAGENÓMICA
bibliotecas metagenómicas
ejemplos:
METAHIT (EU)
Microbioma humano (USA)
aplicaciones:
medio ambiente
terapia
industrial
EPIGENÓMICA
modificaciones en la cromatina
regulación de la expresión génica
ejemplos:
metilación citosinas
histonas
acetilación
metilación
fosforilación
FARMACOGENÓMICA
respuestas individuales a medicamentos
genes relevantes
enzimas metabólicas
proteínas de transporte
moléculas mediadoras
TÉCNICAS
SECUENCIACIÓN CLÁSICA: SANGER
SECUENCIACIÓN DE NUEVA GENERACIÓN (NGS)
más barato
menos errores
BASE DE DATOS
SRA (sequence read archive)