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ALGORITMOS HEURISTICOS PARA MSA - Coggle Diagram
ALGORITMOS HEURISTICOS PARA MSA
PROGRESIVO
CLUSTAL
ETAPAS
CREACION ARBOL GUIA
CON LA MATRIZ DE DISTANCIA ENTRE PARES
ALINEAMIENTO PROGRESIVO DEL RESTO DE SECUENCIAS
PROGRAMACION DINAMICA
SIGUE EL ORDEN DEL ARBOL GUIA
FRENTE A SECUENCIAS CONSENSO
ALINEAMIENTO POR PARES (PROGRAMACION DINAMICA)
PROBLEMAS
INFLUENCIADO POR EL ORDEN DE LAS SECUENCIAS
PRPAGACION DE ERRORES SI EL PAR INICIAL ES MUY DIVERGENTE
NO ADECUADO PARA SECUENCIAS DE DIFERENTE LONGITUD
ITERATIVO
MUSCLE
ETAPAS
MODIFICAR EL ARBOL GUIA
REVISAR PUNTUACION Y VER SI MEJORA
REALIZAR REALINAMIENTOS
VENTAJAS
DESHACE LA DEPENDENCIA DEL PAR INICIAL
REDUCE ERRORES DE LOS PROGRESIVOS
SUELE INTRODUCIR MENOS GAPS
PRECISO Y RAPIDO
CONSISTENCIA
T-COFFEE
ETAPAS
EXTENSION DE BIBLIOTECA
USAR TERCERAS SECUENCIAS PARA MODIFICAR LA PUNTUACION DEL PAR
ALINEAMIENTO PROGRESIVO CON PROGRAMACION DINAMICA
GENERAR BIBLIOTECA DE ALINEAMIENTOS GLOBALES Y LOCALES DE PARES DE SECUENCIAS
CARACTERISTICAS
INADECUADO PARA MUCHAS SECUENCIAS
ES LA MEJOR OPCION