Como con otros parasites protozoarios puede existir el estado de portador de B. coli asintomático, La enfermedad sintomática se caracteriza por dolor e hipersensibilidad abdominal, tenesmo, náuseas, anorexia y heces liquidas con sangre y pus. Puede observarse la ulcera de la mucosa intestinal, como en la amebiasis; puede existir una complicación secundaria, provocada por la invasión bacteriana en la mucosa intestinal erosionada.