Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
MATRICES DE SUSTITUCION O DE PUNTUACION DE AMINOACIDOS - Coggle Diagram
MATRICES DE SUSTITUCION O DE PUNTUACION DE AMINOACIDOS
BASADO EN EXPERIMENTACION
RAZON DE VEROSIMILITUD(ODDS)
PROBABILIDAD DE QUE UN AA CAMBIE A OTRO FRENTE A QUE LO HAGA AL AZAR
LOG ODDS <1
CAMBIOS NO FAVORECIDOS
LOG ODDS >1
CAMBIOS PREFERENTES
PAM(POINT ACCEPTED MUTATION)
MEJORES PARA ALINEAMIENTOS GLOBALES
LOG ODDS EN BASE 10
ESTUDIOS EVOLUTIVOS DE UN GRUPO DE PROTEINAS
NOMBRE MATRIZ
% DE MUTACIONES EN LA SECUENCIA
PAM 1(1% DE CAMBIOS
PARA SECUENCIAS DIVERGENTES
PAM 250
PARA SECUENCIAS PARECIDAS
PAM 30
PAM n
MULTIPLICACION MATRICIAL DE PAM 1 N VECES
BLOSOM(BLOCK SUBSTITUTION MATRICES)
MEJORES ALINEAMIENTOS LOCALES
LOG ODDS EN BASE 2
2000 'BLOCKS' DE 60 AA MAXIMO SIN GAPS
NOMBRE MATRIZ
% IDENTIDAD SECUENCIA DE PARTIDA
BLOSUM 62 (USA EBI POR DEFECTO)
PARA SECUENCIAS DIVERGENTES
BLOSUM 45
PARA SECUENCIAS PARECIDAS
BLOSUM 90