多分子特征数据库
基因/mRNA
综合表达数据库：AOE，GEO，ArrayExpress
肿瘤表达数据库：TCGA，ICGC，TARGET，UCSC/XENA
肿瘤在线分析工具：Gepia2，cBioportal
蛋白质
miRNA
lncRNA
miRBase数据库：https://www.mirbase.org/
多物种miRNA综合数据库：序列、检索、下载
TargetScan数据库：http://www.targetscan.org/
miRNA靶基因预测
starBase v2数据库：https://starbase.sysu.edu.cn/starbase2/index.php
starBase v3/ENCORI数据库：https://starbase.sysu.edu.cn/index.php
mRNA-RNA，miRNA-RNA，lncRNA-RNA，circRNA-RNA，蛋白质-RNA
NONCODE数据库：http://www.noncode.org/
非编码RNA，主要是lncRNA
检索，比对，序列，ID转换，功能分类，疾病相关
LNCipedia数据库：https://lncipedia.org/
lncRNA序列注释信息
LncBase v.2：https://carolina.imis.athena-innovation.gr/diana_tools/web/index.php
DIANA-LncBase v3：https://diana.e-ce.uth.gr/lncbasev3/home
miRNA-lncRNA预测（计算和实验证据）
miRcode数据库：http://mircode.org/
miRNA和lncRNA靶基因预测
LncTar数据库：http://www.cuilab.cn/lnctar
lncRNA-mRNA预测
IntaRNA数据库：http://rna.informatik.uni-freiburg.de/IntaRNA/Input.jsp
通过序列预测lncRNA-RNA相互作用
LncRRIsearch数据库：http://rtools.cbrc.jp/LncRRIsearch/index.cgi
lncRNA-RNA，lncRNA-lncRNA
LongTarget数据库：http://lncrna.smu.edu.cn/
lncRNA-DNA序列
lnCAR数据库：https://lncar.renlab.org/
癌症lncRNA表达数据库
HPA人类蛋白质数据库：https://www.proteinatlas.org/
蛋白质互作STRING数据库：https://string-db.org/
circRNA
exoRBase2数据库：http://www.exorbase.org/exoRBaseV2/toIndex
疾病相关circRNA及序列
circRNADisease数据库：http://cgga.org.cn:9091/circRNADisease/
疾病circRNA
CSCD数据库：http://gb.whu.edu.cn/CSCD/
CSCD2数据库：http://gb.whu.edu.cn/CSCD2/
肿瘤circRNA
MiOncoCirc数据库：https://mioncocirc.github.io/
肿瘤circRNA
TSCD数据库：http://gb.whu.edu.cn/TSCD/
组织特异性circRNA表达，circRNA-RBP或miRNA
circInteractome数据库：https://circinteractome.nia.nih.gov/
circRNA序列，circRNA-RBP或miRNA
circBase数据库：http://circbase.org/
circRNA序列/检索/下载
UniProt蛋白质序列和ID：https://www.uniprot.org/
PDB蛋白质结构数据库：https://www.rcsb.org/
