Бүйрек тастарының себептері жеткіліксіз зерттелген. Метаболикалық бұзылулар белгілі бір рөл атқарады: фосфор-кальций, оксал қышқылы, зәр қышқылы және сирек аминқышқылдары. Зәр шығару тастарының пайда болуының маңызды факторлары-инфекциялар және бүйрек пен зәр шығару жолдарының уродинамикалық функциясының бұзылуы. Фосфор-кальций алмасуының бұзылуы гиперпаратиреоз, кейбір эндокринопатиялар, сүйек жарақаттары, гипервитаминоз D, сілтілер мен кальций тұздарының ұзақ уақыт қабылдануы, яғни бүйрек кальций мен фосфаттардың шамадан тыс шығарылуына байланысты. Кальций фосфатынан алынған тастар зәрдің рН-да шамамен 7,0 құрайды. Оксалат қышқылының тұздарының көбеюі және кальций оксалатынан тастардың пайда болуы оксалаттардың шамадан тыс эндогендік түзілуіне және метаболизм нәтижесінде оксалатты құрайтын оксалат қышқылының немесе заттардың тамақпен шамадан тыс жеткізілуіне байланысты (мысалы, аскорбин қышқылының үлкен дозаларын қабылдау). Оксалаттар зәрдің рН 5,5 шамасында және кальций иондарының концентрациясының жоғарылауымен тұндырылады. Оксалаттардың ерігіштігі несепте магний иондарының қатысуымен күшейеді.