El periodo de incubación de la criptosporidosis es de uno a 12 días, y el sujeto la adquiere de algún animal infectado, de heces de personas, o de alimentos o aguas contaminados por estas últimas. En el caso de personas de alto riesgo (p. ej., pacientes inmunodeprimidos, niños pequeños o adultos de edad avanzada), se necesita evitar el contacto con heces de animales y cumplir con gran cuidado las medidas sanitarias.