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3bre_template_overview (for VV2380 protein), 細胞膜上的 (英文), 2CS的別稱, HK的別稱,…

- - - - (extracytoplasmic) 細胞外的sensor domain
        
        :check: PAS // PAS為最常見的胞外sensor domain，位於胞外空間的PAS domain也可稱為 periplasmic PAS domain，:pencil2:圖上標示的是會辨認檸檬酸(citrate)者，稱為 PAS domain of CitA (a transmembrane histidine kinase)。
        
        :check: tandem PAS (串聯在一起的PAS) // :pencil2:圖上標示的是與PAS串連在一起的 sensor domain of KinD (sporulation-kinase-D sensor domain) 。只有:warning: 位於 N端的KinD 用來接收配體 (ligand)。
        
        :check: 所有 α - helices // α - helices為最常見的胞外sensor domain，圖上標示的是 sensor domain of TorS 。// :pencil2:此蛋白屬於調控細胞呼吸作用的受體系統 (receptor system)，並且由 TorT (TMAO-binding protein)、 TorS (TMAO-sensor histidine kinase)、 TorR (TMAO-response regulator)。其中 :pencil2:TMAO 是幾乎所有海洋生物都有的、用於調節滲透壓的物質(osmoregulator)，全名是 trimethylamine-N-oxide (TMAO) ，對生活在海洋的大多數細菌來說，TMAO作為呼吸作用(respiratory catalysis)中最終接收電子的受體(terminal electron acceptor)
      - (cytoplasmic)細胞內的sensor domain
        
        GAF
        
        PAS
    - - (cytoplasmic)細胞內的訊息傳遞蛋白有很多，圖上僅標示出 HAMP domain of Af1503 // HAMP的全名是 Histidine kinases, Adenyl cyclases, Methyl-accepting proteins, and phosphatases(去磷酸根、磷酸鍵水解酶) // :pencil2:在所有細菌體中都可以發現由 HAMP domain 介導的訊息傳遞路徑，他就好比一個訊息傳遞中樞(central signal converter)，屬於細胞膜上(transmembrane)偵測化學訊號的(chemosensory) histidine kinase ，同時也作為細菌的趨化蛋白受體(chemotaxis receptor)
      - (cytoplasmic)細胞內的訊息傳遞蛋白，STAC domain 的全名是 SLC, TCST-Associated component ，其中solute carrier(SLC)是載體蛋白、two-component signal transduction (TCST)是2CS。 :no_entry: 目前訊息較少仍須爬文。
      - 通常，HK由以下被保留的3個結構域 (conserved domain)組成，包含 DHp domain 、 Catalytic ATP-binding domain (CA) on C-terminal ，以及位於HK中心的 Kinase HK853 // 其中，DHp的全名是 dimerization and histidine phosphotransfer 。:pencil2:HK的CA結合上ATP後，由DHp轉移高能磷酸鍵到HK上使其磷酸化，於此同時HK將釋放出一個ADP。HK的CA接受磷酸鍵而活化後就能傳遞訊號給下游的RR (response regulator)。 :red_flag: 簡單來說，HK被磷酸化活化後可傳遞訊號給下游的RR。
- - - - 可能包含多個 transmembrane helix (TMH)，TMH包含多個埋在細胞膜內的部分稱為 buried part