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ALINEAMIENTOS - Coggle Diagram
ALINEAMIENTOS
TERMINOLOGIA
conservación
elementos comunes
distancia
nº de cambios
identidad
coincidencias
homología
ancestro común
tipos
ortología
distintas especies
paralogía
misma especie
similitud
parecido entre secuencias
OBJETIVO
estudio evolución (árboles filogenéticos)
control calidad de HTS (secuenciacion)
búsqueda de funciones biológicas
predicción de estructuras 3D
SISTEMAS DE PUNTUACION
simple
coincidencias totales
porcentaje de identidad
coincidencias en 100
porcentaje de similitud
aa similares en 100
requiere MATRICES de PUNTUACION
TIPOS
múltiple (3 o más secuencias)
contra bases de datos (BLAST)
de pares de secuencias
RESULTADOS
sustitución / mismatch
aa semiconservativos (.)
aa conservativos (:)
aa no conservativos
indel o gaps
son penalizados
coincidencia / match (*)
cambios en secuencias
por errores en replicación de ADN
tipos: sustituciones, inserciones, deleciones
hipótesis
posiciones importantes: CONSERVADAS