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Siguiendo de cerca las variantes del SARS-CoV-2 en las Américas, Todas las…
Siguiendo de cerca las variantes del SARS-CoV-2 en las Américas
La secuenciación genética
es una técnica de laboratorio
permite leer el genoma de un virus.
permite monitorear los cambios que sufre el genoma del virus
recopilar información sobre esas mutaciones, para ayudar a determinar si el virus se ha vuelto más transmisible
se pueden descubrir nuevos patógenos
cada organismo posee una secuencia genómica exclusiva.
El virus SARS-CoV-2
Sufren cambios en el genoma del virus
“mutaciones” o “variantes”.
su estudio
sirve para la detección de mutaciones o variantes
puedan modificar la tasa de transmisión o el poder patógeno del virus
Según Ruiz (2020)
menciona que "Los coronavirus son virus cuyo genoma es una molécula de RNA de cadena sencilla y polaridad positiva (lo que significa que la secuencia de bases es la misma que la de los RNAs mensajeros)."
el seguimiento geográfico y temporal de las mutaciones
puede ayudar a rastrear su propagación
conocer mejor las posibles vías y la dinámica de transmisión.
La vigilancia del SARS-CoV-2
Es clave para detectar
La gravedad de la COVID-19
la eficacia de las vacunas, los tratamientos, el diagnóstico u otras medidas de salud pública y social
cambio en la secuencia del virus que pueda influir sobre su propagación
Haití fortalece la detección de variantes
La capacidad para hacer pruebas de PCR
fue fortalecida en Haití a través de la cooperación de la OPS.
El país puede hacer la vigilancia y tamizaje inicial de tres de las variantes de preocupación.
puede acceder a los laboratorios de referencia para secuenciar muestras
para confirmar o detectar variantes de preocupación, incluida delta.
La OPS y la Red Regional de Vigilancia Genómica de COVID-19 (COVIGEN)
hicieron posible la llegada de muestras al laboratorio
pudieron ser secuenciadas por primera vez
la presencia de dos de las variantes de preocupación se confirmó.
De la toma de muestras a las medidas de salud pública
Se realiza algunos ensayos que detectan cambios específicos de cada variante.
Son considerados preliminares y deben ser complementados con la secuenciación.
no son suficientes para clasificar el virus como una de las variantes de preocupación o de interés reconocidas
La secuenciación genómica completa
Es requerida para que se pueda confirmar la variante de preocupación
recogida de muestras.
son enviadas al laboratorio nacional de virología de un país
se preparan las muestras para la secuenciación
Se realiza una serie de ensayos que funcionan igual al diagnóstico
Sirve para reconocer algunas de las mutaciones del virus y tamizar entre las muestras para ver cuáles pueden ser alpha, beta o gamma,
Análisis bioinformático
Permite
Confirmar la presencia de alpha, beta o gamma
Identificar delta y cualquier otra variante que pueda surgir
Datos
son publicados en GISAID para que la información esté disponible
Ha posibilitado el desarrollo de capacidad de vigilancia genómica del virus SARS-CoV-2 en todo el mundo.
Por medio de la vigilancia genómica del SARS-CoV-2
Los expertos interpretan los datos obtenidos para conocer las linajes y variantes circulantes
Comparten su análisis con los responsables de la respuesta a la pandemia para asesorar las medidas de salud pública y las recomendaciones a la población.
Honduras: Red de Vigilancia Genómica ayuda a confirmar la variante alpha
La capacidad para hacer secuenciación y confirmar la identidad de esas muestras o de encontrar otras variantes que escapan a la PCR de tamizaje
Se confirmó la presencia de la variante de preocupación alpha en Honduras.
El laboratorio hondureño
Protocolo para VOC (variantes de preocupación)
permite tamizar tres de las cuatro variantes de preocupación que comparten las mismas mutaciones
el tamizaje no reemplaza la secuenciación
los protocolos y PCR permiten detectar las variantes alpha, beta y gamma, pero no funcionan para la variante delta
no posee la misma mutación.
Los análisis del laboratorio
han arrojado un dato importante
La gente joven ha sido más afectada por las variantes
Realizó las pruebas PCR para detección de las variantes alpha, beta y gamma
es el pilar del diagnóstico
los resultados oportunos permiten tomar acciones oportunas
Junio de 2021
el Laboratorio Nacional de Virología de Honduras
a través de la prueba PCR
Detectó la presencia de algunas de las variantes de preocupación.
Marzo 2020
creación de Red Regional de Vigilancia Genómica de COVID-19
integran laboratorios de salud pública de 24 países de la región.
aportar al conocimiento global sobre el virus
Incrementar la cantidad de datos de secuenciación disponibles
Dar a conocer una secuencia del virus que causa la COVID-19
se mejoren protocolos de diagnóstico
se genere información para el desarrollo de vacunas.
se tomen acciones de salud pública
ha plantado la semilla
para detectar nuevos virus o patógenos que pueden surgir
para estar preparados para enfrentar la próxima pandemia.
Ministerio de Salud de Paraguay realiza por primera vez secuenciación de SARS-COV
La OPS facilitó insumos y reactivos para la realización de las pruebas
Utilizan las pruebas PCR en tiempo real para hacer tamizaje de variantes
realizaron con éxito su primera secuenciación a fines de julio pasado.
Identifican la variante de preocupación delta y la de interés lambda.
secuenciación genómica de los virus
Requiere una gran inversión que va desde equipos de alto costo, recursos humanos capacitados, reactivos y otros insumos,
No todos los países tiene estas instalaciones.
Según González (2020)
menciona que "El primer genoma de SARS-CoV-2 se obtuvo en Wuhan a finales de diciembre de 2019. Esto permitió identificar al virus como un coronavirus y comprobar que era diferente a los otros coronavirus conocidos."
Variantes de interés y preocupación en las Américas
La mutación
el SARS-CoV-2 ha mutado y evolucionado
Virus mutado
una variante del virus original
pueden ser ventajosas para el virus
se vuelva más transmisible o facilita que se escape de la respuesta inmune
es parte natural del proceso de evolución de los virus.
Una variante es considerada de interés
cuando ha cambiado en relación con el virus original y se ha identificado que causa transmisión comunitaria/múltiples casos/clústeres de COVID-19
se ha detectado en varios países.
Alpha fue detectada en 45 países
Beta en 20 países
Gamma en 31 países
Delta en 31 países
Julio 2021
la OMS identificó cuatro variantes de interés a nivel global (eta, iota, kappa y lambda)
2 han sido detectadas en las Américas (lambda y Iota).
Una VOI pasa a ser una variante de preocupación
Está asociada con un aumento de la transmisibilidad o cambio perjudicial en la epidemiología de la COVID-19
si aumenta la virulencia o cambia la presentación clínica de la enfermedad
si disminuye la eficacia de las medidas de control o del diagnóstico disponible, las vacunas y terapias.
Tienen mayor capacidad para transmitirse y replicarse,
Medidas a tomar
El distanciamiento físico
El uso de mascarillas
La vacunación
evitar las aglomeraciones
control de las infecciones mediante la realización de pruebas
el rastreo de contactos
aislamientos y las cuarentenas.
Según Vela (2020) menciona que
Las medidas a tomar: son el uso de máscaras, practicar la higiene de manos, evitar el contacto con otras personas, la detección rápida de casos y su rastreo
Virus
En su proceso de evolución busca transmitirse más fácilmente a más personas
los virus evolucionan para convertirse en más transmisibles
puede ocurrir también con el virus que causa la COVID-19.
son organismos que evolucionan.
Todas las cuatro VOC han sido identificadas en 12 países de la región.
Las vacunas existentes protegen contra todas las variantes que circulan actualmente a nivel global
EVITAR SU PROPAGACIÓN
Juliana Leite (2020)
Ito Journel (2020)
Mendez Rico (2020)