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Biofilm formation of Vibrio cholerae (霍亂弧菌之生物膜形成) - Coggle Diagram

- - - - 單端向纖毛(single polar flagellum)
    - - 非蛋白質
        
        MSHA pili 纖毛
      - 蛋白質
        
        RbmA，協助細菌貼附
  - - - 使細菌聚集
      - 維持立體結構
    - - RbmA
        
        生物膜雛型建構
        
        穩定生物膜
      - RbmC
        
        (表面)形成彈性支架，協助細菌複製生長(細胞數量增加)
      - Bap1
        
        穩固pellicle的構造
        
        Pellicle是生物膜的一部分，以所處位置區分，處於液體&空氣接觸的表面位置(air-liquid interface of biofilm)的生物膜，稱為pellicle。
        
        決定了生物膜的疏水結構(hydrophobicity)
- - - - 生成
        
        抑制條件：降低AI-2、CAI-1濃度(含量)
        
        促進條件：提升AI-2、CAI-1濃度(含量)
      - 活化
        
        促進生物膜的dispersal
  - - - VpsT protein
        
        嵌合在RbmA DNA sequence上
        
        嵌合在RbmC、Bap1 DNA sequence的promoter上
      - VpsR & VpsT protein可以調節matrix protein synthesis
      - VpsR & VpsT 都是促進生物膜形成的activator
        
        提高了生物膜形成所必需的蛋白的表現量
    - - VpsR & VpsT protein 可以接在多醣體的基因序列上
    - - c-di-GMP
        
        菌體內濃度 / intracellular concentrations
        
        有表現，不論濃度
        
        濃度低
        
        嵌合在VpsR蛋白質上
        
        X
        
        嵌合在VpsT蛋白質上
        
        X
        
        濃度高
        
        4 more items...
        
        和 ATPase MshE 交互作用
        
        調節MSHA pilus的伸縮功能 / extension and retraction
        
        和細菌的機動性相關
        
        調控
        
        降解 / 降低
        
        Phosphodiesterase(s)降解成GMP
        
        由EAL domain表現
        
        合成 / 產生
        
        DGCs / diguanylate cyclase(s)合成c-di-GMP
        
        研究顯示，小腸道的mucus變少時，菌體內的 c-di-GMP含量上升；反之則降。
        
        和GGDEF motif 有關
        
        (創傷弧菌)目前已知共有31種蛋白質上，具有GGDEF domain；共有10種蛋白質同時具有GGDEF domain & EAL domain
        
        1 more item...
        
        功能
        
        2 more items...
- - - - 但，不清楚異位抑制的機轉
      - 可能還會有sensory domain
        
        推測和DGC如何應對環境因子有關
- - - - 嵌合在STING上，活化先天性免疫反應
        
        但，不清楚先天免疫反應對於菌體內c-di-GMP的影響
  - - - Gallego-Hernandez AL, DePas WH, Park JH, Teschler JK, Hartmann R, Jeckel H, Drescher K, Beyhan S, Newman DK, Yildiz FH. Upregulation of virulence genes promotes Vibrio cholerae biofilm hyperinfectivity. Proc Natl Acad Sci U S A. 2020 May 19;117(20):11010-11017. doi: 10.1073/pnas.1916571117. Epub 2020 Apr 30. PMID: 32355001; PMCID: PMC7245069.