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Evolución de los genomas 2. - Coggle Diagram
Evolución de los genomas 2.
Secuencias repetitivas y transposones.
DNA Satélite o repetitivo
Transposones o elementos transponibles (Ets)
No contribuyen en el funcionamiento del org. huésped.
Codifican prot. esenciales para la transposición y replicación del propio retroelemento.
Secuencias que pueden transponerse, mov. a otras reg. del genoma.
Dan lugar a nuevas funciones en el org. húesped.
Son retrotransposones, usan copias intermedias de RNA que se retrotranscriben a la secuencia de DNA que se transpone.
Clasificación de Transposones
Clase III o MITE (miniature inverted-repeats transposable elements).
Clase II o DNA transposones
.
Se mueven de una posición a otra en el genoma usando
Transposasa
para cortar y pegarse en otros locus.
Clase I o Retrotransposones.
Se transcriben a RNA y tienen transcripción inversa a DNA por retrotranscriptasa.
LINEs
(long interspersed nuclear element)
Retrotransposones con LTR (Long terminal repeat)
de origen retroviral.
SINEs
(short interspersed nuclear element)
Retrotranposones sin LTR
, de origen no retroviral.
Evolución de los genes que codifican para Prot.
Evolución de reg. codificantes por Selección positiva
Selección natural favorece cambios en una prot.
Estadística simple basada en comparación de la secuencia de DNA del mismo gen en 2 especies ≠.
Relación dN/dS.
dN
: Frec. de mutaciones no sinónimas. Se acumulan mucho más rápido.
dS
: Frec. de mutaciones sinónimas.
dN/dS=1
Las mutaciones sinónimas y no tiene poco efecto sobre la eficacia biológica, por lo que ambas tienen la misma posibilidad de desplazarse en la pobl. para fijarse.
dN/dS < 1
↑ mutaciones no sinónimas son perjudiciales y se eliminan por selección purificadora
dN/dS > 1
mutaciones no sinónimas que se fijan tienen impulso por selección positiva.
Evolución de reg. codificantes por deriva genética
Posición de las bases de los codones
Bases en 1º y 2º posición evolucionan lentamente.
Los cambios puede que no sean sinónimos (cambia la prot.)
Bases 3º posición evoluciona + rápido.
Cambios sinónimos (Prot. =)
Como es sinónimo se espera que tenga un efecto ↓ sobre la eficacia biológica y pueden propagarse en la especie por deriva genética contribuyendo a las ≠ entre especies.
Cambios por Selección natural → patrón opuesto.
Selección direccional o positiva
Aceleración del reclutamiento de mutaciones ventajosas en una pobl.
w=dN/dS
w>1
nº sustituciones ventajosas ↑ que sust. neutras
w<1
opera la selección estabilizadora o purificadora.
Deriva > selección positiva
Selección natural estabilizadora y direccional
Con mutaciones recesivas + eficiente en Cromosoma X que en autosomas
Recesivo autosomas de ♂ y ♀ enmascarado por efectos fenotípicos.
Sesgo de codones
Mutación
:
Bases: G a A; C a T. Son el doble de comunes que otras.
Acumulación de codones con bases A y T.
≠ codones para =aa.
SN
:
mutaciones sinónimas son selectivamente neutras, efectos min en eficacia biológica.
Impulsados por selección son + fuertes en genes ↑ expresados y especies con poblaciones grandes.
Poblaciones peq. la deriva abruma cualquier selección, sesgo débil o ausente.
Origen de nuevos genes
Todos los genes del genoma humano descienden de 1 o un conjunto de genes.
nº genes funcionales ≠ entre org.
≠ Mecanismos por los cuales se han originado genes a partir de preexistentes del mismo genoma.
Origen de genes tienen nuevas funciones.