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Altération épigénétique & Cancer - Coggle Diagram

- - - - SAM lie CH3 sur C
      - Ilots CpG au niv du prom (démétyl° maj)
      - Qq CpG dans régions codantes (méthyl° maj)
      - Maintien profil de méthyl° au cours des divisions par DNMT1
      - Inhibition trans° par encombrement du prom OU modif conformation de l'ADN
      - Rôle physio : inactivation X, empreinte génomique parentale (exp° monoallèlique d'un seul parent et repression stable tout au long de la vie de l'aute allèle), maintien intégrité génome
    - - Nucléosome : ADN + 2H2A + 2H2B + 2H3 + 2H4
      - Modif post trad : accessibilité (euchromatine) ou compaction (héterochromatine)
      - Enzymes
        
        HAT : neutraliser charge + des histones ainsi brin ADN prédomine en terme de charge ce qui permet de relacher ADN et favoriser trans° → acétyl°
        
        HDAC : compaction en inhibant charges nég → déacétyl°
        
        HMT
        
        LSD1
  - - - ADN modifié par bisulfite de sodium → technique de frommer : désamination oxydative par bisulfite qui convertit C en U → PCR
      - MSP = methyl-specific PCR
      - COBRA = COmbined Bisulfite Restriction Assay/Analysis : Bisulfite-PCR → Quantification par digestion par ER, PAGE, hybridation oligont, phosphoimager quantitation
      - Pyroséquençage : dosage luminométrique du pyrophosphate produit après ajout d'une base durant la réaction de polymérisation
      - Séquençage haut débit
    - - Principe : étudier sur une portion de l'ADN la présence d'histones acétylés ou méthylés
      - 1) Pontage covalents ADN/prot par formaldéhyde 2) Lyse des cell et fragmentation de la chromatine 3) IP 4) Inversion des pontages et extraction de l'ADN 5) qPCR avec primers spé pour différentes régions OU couplage à un séq haut débit