Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
Proteomics - Coggle Diagram
Proteomics
Top-down
Targeted
Na opzuivering (meestal affinity-based)
Infusion MS
Mass envelops
Deconvolutie om MW te bepalen
Geen scheiding
gebasseerd op PTMS of functionaliteit
Non-targeted
SDS-(CE) (scheiding op grootte)
Detectie op Gel (via staining)
(c)IEF (scheiding op pI)
IEF-SDS (2D) (scheiding op grootte en pi)
Geen digestie
Labeled of label free
Labeling helpt bij relatieve kwantificatie
(via staining)
Bottom-up
Targeted
Na opzuivering (meestal affinity-based)
gebasseerd op PTMs of functionaliteit
Meestal in-solution digest
Non-targeted
Gel scheiding
In-gel digestion
Extractie peptides
Ontzouten
LC-MS/MS
Database searching
Labeling en label free
In-solution digest
Denaturatie, reductie, alkylatie, digestie
Labeling of label-free
PTMs kunnen ook hierin bepaald worden
Onderzoeksvragen over eiwitten en hun veranderingen in een biologisch systeem
Proteoforms: Zelfde eiwit met verschillende of verschillende hoeveelheid PTMs
Gaat vaak over afwijkend versus normaal
Vergelijken monsters kan via labeling of label-free