Indirek hiperbilirubinemia dapat disebabkan oleh (1) naiknya bilirubin yang harus dimetabolisme oleh liver (anemia hemolitik, polisitemia, berkurangnya usia sel darah merah yang disebabkan oleh imaturitas atau transfusi sel, naiknya sirkulasi enterohepatik, dan infeksi); (2) rusaknya atau berkurangnya aktivitas enzim transferase atau enzim-enzim lain yang terkait (genetic deficiency, hypoxia, infeksi, defisiensi tiroid); (3) blok dari ensim transferase (obat-obatan).