A técnica de aplicação do flúor é feita pelo dentista, e pode ser realizada de diversas formas, entre elas, o bochecho da solução, a aplicação direta de verniz de flúor, ou com o uso de moldeiras ajustáveis com gel. O flúor concentrado deve ficar em contato com os dentes por 1 minuto, e após a aplicação, é necessário ficar ao menos 30 minutos a 1 hora sem ingerir alimentos ou líquidos.