Please enable JavaScript.
Coggle requires JavaScript to display documents.
Métabolomique - Coggle Diagram
Métabolomique
Analyses
-
-
-
-
Analyses données
Entrée : matrice de concentration (ciblée) ou d'intensité (non ciblée), nomination classe, facteurs expérimentaux
Sortie : caractéristiques discriminantes, modèles cluster, conclu bio, biomarqueurs, modèles prédictifs
-
Data cleaning
Normalisation
De l'échantillon = row-wise : éliminer variations des conditions expérimentales
sans rapport avec les différences biologiques
-
-
-
-
Introduction
Métabolites = AA, sucres, nt, lipide (lipidome) → petites molécule qui ne dépasse pas 1500 Da, exo et endogène = exo et endométabolites.
-
-
-
Design expérimental : 1) Objectif clair 2) Nombre d'échantillon 3) Stratégie d'échantillon 4) Réplica 5) Analyses technologiques 6) Collecte des méta données 7) Confounding factors 8) Randomisation 9) Strat d'analyse des données 10) Interprétation bio 11) Validation 12) Name it
Métabolomique
-
Non ciblée
-
Limites : stockage données, précision, on ne sait pas ce qu'on cherche, temps, identification
-
Technologies
-
-
→ pour échantillon liquide, gazeux ou solide
-
