Tient compte de la couverture pour CpG et génome, profondeur, taux de conversion avec méthodes de bisulfite (99%), méthyl° CpG ou non CpG, relier méthyl° avec structure ou encore éléments régulateurs, observer DMR (Differentially Methylated Regions), ontologie du gène = annoter les différentes fonctions d'un gène (fonction moléculaire, loca, fonction phénotypique et métabolique)