Vistas alternativas
Por ejemplo, Amborella + Nymphaeaceae o Nymphaeaceae sola han sido reportadas ocasionalmente como hermanas de todas las demás angiospermas. Sin embargo, los análisis estadísticos de estos enraizamientos alternativos utilizando un conjunto de datos de hasta 11 genes generalmente favorecen al árbol con Amborella como hermano del resto, aunque el árbol Amborella + Nymphaeaceae no siempre pudo ser rechazado . Además, la diferencia entre estas tres topologías es relativamente menor y consiste únicamente en la ubicación relativa de Amborella y Nymphaeaceae. , Amborella era hermana de Calycanthus de Laurales, una posición consistente con la descripción original de Amborella, pero claramente en desacuerdo con otros aspectos de la morfología .
Cuando Nymphaea o Austrobaileya , que representan a Nymphaeaceae y Austrobaileyales, respectivamente, fueron sustituidas por Amborella , cada una apareció como la hermana de Calycanthus . , exactamente en la misma posición que había ocupado Amborella , presumiblemente porque el conjunto de datos, que estaba limitado a un subconjunto de aquellas especies de plantas para las que se dispone de secuencias completas del genoma de plástidos, no contenía otros parientes cercanos. Además, la representación de las monocotiledóneas por taxones distintos de las gramíneas, que residen al final de una rama larga , dividió la rama larga en las monocotiledóneas y dio como resultado la topología « Amborella basal». , interrumpiendo también la rama larga de las gramíneas, Amborella reanudó su posición como hermana de las otras angiospermas .