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Natural language processing in text mining for structural modeling of…
Natural language processing in text mining for structural modeling of protein complexes
[1]
V. D. Badal, P. J. Kundrotas y I. A. Vakser, "Natural language processing in text mining for structural modeling of protein complexes", 2018, file:///C:/Users/leciz/Downloads/Natural%20language%20processing%20in%20text%20mining%20for%20structural%20modeling%20of%20protein%20complexes.pdf.
La etapa básica del proceso, consiste de 2 paso:
"INFORMATION RETRIEVAL"
El
abstract
viene de PubMed usando NCBI E-utilidades
Nombres de 1 o 2 proteínas están presentes en el
abstract
Salen nombre residuales del texto de
retrieved abstracts
Se filtra el conjunto de residuos mediante:
Correspondencia del nombre y el número de los residuos extraídos del PDB
Se hace uso de ésta para el protocolo para un PPI en particular, determinando en que N contiene el residuo recuperado
1 more item...
Presencia del residuo extraído en la superficie de la proteína
"INFORMATION EXTRACTION"
En mi opinión, se me hace un proceso extremadamente útil para extraer la información. Aunque es un método un poco complicado de entender en un inicio, sirve muy bien como apoyo
