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Rétrovirus 2 - Coggle Diagram
Rétrovirus 2
Découverte et épidémiologie
HIV
Découverte VIH-1 en 1983 par François Barré-sinoussi
VIH-2 en 1986 par Françoise Brun-vézinet et caractérisé par François Clavel
Classification HIV + prévalence
VIH-1 et VIH-2 -> 50% homologie -> bien identifier pr utilisation ttt
Groupe M + présent -> comporte nb recombinaison (94)
ARN linéarité positif recombiner bcp
=> Gde diversité génétique de ces virus
Variabilité intra-groupe CARTE
Diversité
Plupart VIH-1 appartient au groupe M avec 9 sous-types : A, B (+répandu dn pays occidentaux, C, D, F, G, H, J et K
Afrique -> origine virus + le + riche en sous-types différents avec recombinaison entre sous-types
Groupe O et N + rares -> Cameroun
New groupe VIH-1, P -> patiente camerounaise
VIH-2 -> parton Ouest Afrique Sub-saharienne
Origine
VIH infectant H dérivent virus immunodéfiance simienne (SV) présent chez singes
VIH-1 groupe M et N proches SIVcpz infectant une sous- espèce de chimpanzés dits Pan troglodytes troglodytes
VIH-1 groupes O et P proches des SIVgor infectant les gorilles
VIH-2 plus proche des SIVsmm infectant les sootey mangabey
Explication transm singe -> homme : expo à sang contaminé, lors morsures ou blessure lors chasse et dépeçage des animaux
Berceau épidémiologie VIH-1 est Afrique intertropicale -> Zone + touchée = 25,6 millions infectés = 68%
-> Transm en Afrique : hétérosexuelle + materno-fœtale
En occident, homosexuelle + toxicomanes rôle imp dn initiat° infect°
36,7 millions = nb sujets infecté avec 2,5 millions news infect)/an -> dt 95% dn pays en voie de dvpt
Épidémie en France
Sérologies confirmés + en 2021 : 8948
Tx positivité 2021. : 1,6/1000 sérologies réalisas
Déclaration maladie pas de manière nominative
Indicateur dynamique épidémie : séropositivité HIV
Décrêt n°99-363 du 6 mai 1999 : Modif liste maladies à déclarat° obligatoire en France :
Inclusion séropositivité HIV quel que soit satde maladie
Mise en place par l’InVS 1er semestre 2003
Logiciel anonyme station protégeant pers
Double déclaration biologiste/méd à initiative du biologiste réalisant infection VIH en 2011
Test de confirmation
Surveillance virologique associée : tapage HIV, test infect° récente
Test infect° récente réalisé par centre national de réf VIH sur sérums envoyés sur buvards lors déclaration obligatoire des news cas de séropositivité. permett d’estimer délai d’infection-prélèvement
=> Infection par VIH ets à déclaration obligatoire depuis janvier 2003
Nécessaire et indispensable de renforcer stratégies de dépistage
proposit° de dépistage élargie à pop générale
dépsiateg réêté et ciblé dn pop les plus exposés
Dépistage de infect° VIH à un intérêt individuel indiscutable c améliorat° santé + espérance vie) + intérêt collectif (impact probable sur dynamique épidémie) car ttt antirétroviral réduit nettement risque transmission au niveau individuel
Infect° VIH-2. Représentent 1à2% découvertes séropositivité en France
Diagnostic et suivie virologique
Suivi virologique
Test de résistance génotypique
Quantifier réservoir viral -> ADN VIH à partir cell mononucléées sanguines patient
=> présente intérêt dans des stratégies de simplificat°
Detect° et quantificat° virale par PCR : - ARN viral est quantifié à partir plasma par PCR en tps réel
Techniques permettent déterminer "charge virale", -> nb copies ARNviral/mL plasma
Test commerciaux dn labo pr quantifier VIH-1 groupe M ou O
Recours labo spécialisés pr quantifier charge viral VIH-2
Détect° ARN viral par PCR
Faut administrer ttt direct après le contage, en 48h
ARN viral détectable dès 7 à 10 jours après contage
(+) sensible que antigénémie p24, le remplace pr suspicion de primo-infect°, diagnostic précoce du new-né de mère infectée par VIH
Détect° antigénémie p24
Détectable 15 jours après contage alors que Ac sont présents seulment 22 à 26 jours après.
Test act combinés Ag/Ac très sensibles pr détecter Ag p24 et intérêt de détect° isolée de Ag p24 diminue
Intérêt = diagnostic d'une primo-infect° avt séroconversion Ac
Technique ELISA
Confirmat° par Western-Blot ou immunoblot
1eres prot identifiés sont prot de surface et capside
WB douteux -> Ac an2-p24 isolés -=> new WB 1 à 2 semaines plus tard avec WB VIH-2 car peut correpondre à 3 possibilités :
Début séroconvers° se complétera en 3 semaines
Positivité en VIH-2
Réact° non spé
Profil gp160 + p24 -> début séroconversion
WB est + qd sérum du sujet contient Ac rendant visible au moins 2 bandes d'enveloppe parmi suivantes (gp160, 120 ou 41), et une bande correspondant à une réactivité gag (p55, p24, p18) ou à une réactivité pol (p68, p52, p34).
Western-blot : principaux Ag viraux séparés les un des autres par électrophorèse en f° poids mol et disposés en bande sur languette de nitrocellulose
Dépistage par TROD
Autotest : test rapide chez soi, dispo en pharmacie, autorisée mais confiramat° par test test ELISA combiné puis par Western-blot reste indispensable pr affirmer diagnostique
Quelles circonstances ?
Urgence diagnostique devant la survenue d’une pathologie aiguë évocatrice du stade SIDA
Accident prof d’expo au sang, pr déterminat° du statut sérologique du sujet source afin d’éclairer rapidement la décision de prescript° d’un ttt antirétroviral préventif ;
Accident d’expo sexuelle, pr déterminat° statut sérologique des 2 partenaires afin d’éclairer rapidement la décision de prescript° ttt antirétroviral préventif
Accouchement chez les femmes enceintes dt le statut sérologique par rapport au VIH pas connu ou chez les femmes enceintes ayant eu une exposition supposée au VIH depuis la réalisation du dernier test de dépistage au cours de la grossesse afin de pouvoir envisager une prise en charge thérapeutique immédiate adaptée et de réduire le risque de transmission mère-enfant ;
Test pas même niveau sensibilité que test ELISA combinés au cours primo-infect° : risque être - => retarder/exclure diagnostic infect° VIH
Tests urinaires rapides -> détecter Ac anti-VIH 1 et 2 sur sang tot, serum ou plasma
Test facilement réalisable sans appareillage, avec lect subjective résultat + réalisés aussi par pro santé
TROD = Test Rapide d'Orientation Diagnostique
Difficultés
2010, dépistage en France repose sur utilisat° test combiné 4ème générat° :
Ac anti HIV-1 et HIV-2
Variants rares (groupe O)
Ag p24 du HIV-1
Seuil < 2Ul/mL
Nécessaire à cette étape de différencier infect° VIH-1 ou VIH-2 Existe des réact° antigéniques croisés entre 2 types VIH
Diagnostic validée qu'après confirmat° diagnostic bio par test de confirmat°, + spé et test de 4ème générat° sur échantillon sanguin issu 2nd prélèvement pr parer à toute erreur étiquetage
Défaut de spécificité (0,5% faux positifs dn pop générale)
Indications et principes
Cas résulat +, analyse de confirmation par Western-blot/Immunoblot est réalisée à initiative du biologiste sur même échantillon sanguin
Diagnostic biologique repose légalement sur test immunologique ELISA mixte, combiné à lecture objective permettant detect° Ac anti-VIH-1 et 2 et de Ag p24 du VIH-1 avec un seuil min de détection de Ag p24 (capside) de 2 Ul/mL Test sont communément appelés test combinés de 4ème génération
Dépisatge obligatoire pr dons du sang, organes, tissu, sperme
Dépistage est volontaire, largement proposé, prescrit par médecin avec accord du patient