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Fresh Frozen/FFPE scNGS - Coggle Diagram
Fresh Frozen/FFPE scNGS
Visium: 石蠟檢體貼在此玻片
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石蠟切片有高層度RNA降解,因此利用xone seq去作為探針針針刺表現量(間接測量,因此即使員組織還保有一些RNA也不會被作為測量的RNA)。優點,相較於scNGS與冷切,較不受粒線體表現量影響,所以不會浪費定序量。較像表現量定量的工具。
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微觀視野55um 一個視野平均1-10顆細胞
對於有中空的組織(肺、腎絲球、心臟、主動脈)是否需要撐開?腎絲球水相容易在冷凍包埋退溫過程中塌陷而破碎,因此建議做石蠟。
比較具有容易空間塌陷的實驗的檢體目前都還是建議做石蠟包埋,但脂肪目前都還沒成功。
肝、胰臟、乳腺都還是比較適合石蠟
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