No total, existem 63 portos aduaneiros em território brasileiro — e todos eles são localizados em pontos estratégicos e administrados por empresas privadas. No entanto, vale ressaltar que o controle das operações aduaneiras é feito pela Receita Federal do Brasil. São 35 unidades, que se dividem entre 14 estados de diversas regiões do Brasil, como Amazonas, Bahia, Minas Gerais, Rio de Janeiro e Rio Grande do Sul.
Além disso, existe uma unidade no Distrito Federal e 27 unidades no Estado de São Paulo, divididas entre os municípios. Entre os principais exemplos estão Guarulhos, São José do Rio Preto, Campinas, Suzano, Santo André, São Paulo, Taubaté e Santos.