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Le proteine, La glicina, la cisteina e la prolina sono casi particolari…
Le proteine
possiedono una
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struttura secondaria
è la regolare ripetizione di ripiegamenti caratteristici che interessano regioni diverse della catena polipeptidica
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struttura terziaria
è la configurazione tridimensionale della proteina in cui si distinguono una zona interna , poco accessibile alle interazioni tra molecole e una superficie esterna, i responsabili della struttura terziaria sono le interazioni tra i gruppi R degli amminoacidi
che la compongono
tra le catene laterali di molecole di cistina si possono formare ponti disolforo covalenti che tengono in posizione i ripiegamenti delle catene
le catene idrofobiche si posizionano lontano dell'acqua, cioè all'interno formando un ripiegamento
tra catene laterali cariche positivamente e negativamente all'interno della proteina possono formarsi legami ionici
i legami a idrogeno tra catene laterali idrofile contribuiscono alla stabilizzazione dei ripiegamenti
struttura quaternaria
è il risultato del modo in cui le subunità polipeptidiche si legano insieme e interagiscono tra loro
le subunità sono proteine da due o più catene polipeptidiche ripiegate nella sua struttura terziaria
sono macromolecole formate da amminoacidi uniti fra loro per mezzo di legami covalenti formando catene polipeptidiche
gli amminoacidi (aa) sono composti organici che contengono un gruppo carbossilico(-COO-) e un gruppo amminico (-NH3+) e sono legati ad un atomo di carbonio (alfa) legato ad un atomo di idrogeno e ad una catena laterale detta R
I gruppi R sono diversi in ciascun amminoacido e dai gruppi funzionali che contengono dipendono struttura e proprietà chimiche della molecola, negli organismi viventi ne sono stati scoperti 20
e si suddividono in:
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5 amminoacidi con catene laterali polari, idrofili, che formano legami a idrogeno con l'acqua e altre sostanze polari (o con carica elettrica)
7 amminoacidi con catene laterali costituite da idrocarburi apolari, idrofobici
La glicina, la cisteina e la prolina sono casi particolari poiché:
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La cisteina possiede un atomo di zolfo nel suo gruppo R che può reagire con un altra cisteina formando un ponte disolfuro, un legame tra i due atomi di zolfo, e determina il modo in cui una proteina viene piegata
La prolina ha una scarsa capacità di formare legami idrogeno e ruotare intorno al carbonio a per la sua struttura ad anello.