Um FAN reagente deve ser subclassificado conforme o padrão da imunofluorescência e os autoanticorpos específicos detectados (anti-DNA de dupla hélice, anti-Ro/SSA, anti-La/SSB, anti-Scl-70, anti-RNP, anti-Sm, etc.), e pode ser útil em sugerir o diagnóstico de uma doença reumática específica. Contudo, esses exames não devem ser solicitados rotineiramente